31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1071 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1071  holin  100 
 
 		 141 aa  285  2e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.249678  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2819  toxin secretion/phage lysis holin  65.22 
 
 		 138 aa  199  8e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1704  toxin secretion/phage lysis holin  60.45 
 
 		 136 aa  173  6e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1612  toxin secretion/phage lysis holin  66.67 
 
 		 139 aa  171  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000571336  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0424  toxin secretion/phage lysis holin  65.94 
 
 		 139 aa  167  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0414  bacteriophage phi-105 protein-like protein  64.49 
 
 		 146 aa  161  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1487  Phage-related holin  57.81 
 
 		 180 aa  160  8.000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1269  toxin secretion/phage lysis holin  64.44 
 
 		 136 aa  158  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2945  toxin secretion/phage lysis holin  50.36 
 
 		 137 aa  144  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0122062  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1930  toxin secretion/phage lysis holin  56.39 
 
 		 250 aa  130  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0311958  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1976  toxin secretion/phage lysis holin  53.1 
 
 		 117 aa  124  6e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2685  putative prophage LambdaBa02, holin  47.66 
 
 		 141 aa  120  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0644  toxin secretion/phage lysis holin  46.03 
 
 		 137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4074  prophage lambdaba02, holin  45.31 
 
 		 141 aa  114  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.124565  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3413  toxin secretion/phage lysis holin  45.31 
 
 		 141 aa  114  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000505661  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3785  prophage LambdaBa02, holin  45.31 
 
 		 141 aa  114  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.020072  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2932  toxin secretion/phage lysis holin  42.64 
 
 		 146 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000653947  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5852  prophage LambdaBa02, holin, putative  43.61 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3491  prophage LambdaBa01, holin  42.86 
 
 		 141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000160757  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3768  prophage lambdaba01, holin  42.86 
 
 		 141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116081  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0586  toxin secretion/phage lysis holin  42.62 
 
 		 131 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3577  toxin secretion/phage lysis holin  42.97 
 
 		 141 aa  107  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0161092  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0971  toxin secretion/phage lysis holin  36.69 
 
 		 138 aa  103  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.332324  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0366  toxin secretion/phage lysis holin  37.12 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0370  toxin secretion/phage lysis holin  38.17 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1280  toxin secretion/phage lysis holin  33.87 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2787  Phage-related holin (Lysis protein)-like protein  40.3 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3883  toxin secretion/phage lysis holin  32.2 
 
 		 138 aa  67  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1331  toxin secretion/phage lysis holin  31.48 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2943  toxin secretion/phage lysis holin  25.85 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0683792  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0798  toxin secretion/phage lysis holin  24.62 
 
 		 160 aa  40.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>