29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1976 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1976  toxin secretion/phage lysis holin  100 
 
 		 117 aa  229  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1487  Phage-related holin  62.63 
 
 		 180 aa  131  3e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1071  holin  53.1 
 
 		 141 aa  124  6e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.249678  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2819  toxin secretion/phage lysis holin  47.86 
 
 		 138 aa  122  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1704  toxin secretion/phage lysis holin  54.55 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1269  toxin secretion/phage lysis holin  56.52 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1612  toxin secretion/phage lysis holin  55.43 
 
 		 139 aa  114  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000571336  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0424  toxin secretion/phage lysis holin  54.35 
 
 		 139 aa  110  8.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746936  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2945  toxin secretion/phage lysis holin  50 
 
 		 137 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0122062  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0414  bacteriophage phi-105 protein-like protein  50.52 
 
 		 146 aa  104  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0644  toxin secretion/phage lysis holin  53 
 
 		 137 aa  103  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1930  toxin secretion/phage lysis holin  46.24 
 
 		 250 aa  100  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0311958  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0586  toxin secretion/phage lysis holin  46.88 
 
 		 131 aa  90.1  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3413  toxin secretion/phage lysis holin  42.11 
 
 		 141 aa  87.8  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000505661  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4074  prophage lambdaba02, holin  42.11 
 
 		 141 aa  87.8  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.124565  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3785  prophage LambdaBa02, holin  42.11 
 
 		 141 aa  87.8  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.020072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2685  putative prophage LambdaBa02, holin  42.11 
 
 		 141 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3768  prophage lambdaba01, holin  44.44 
 
 		 141 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3491  prophage LambdaBa01, holin  44.44 
 
 		 141 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000160757  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2932  toxin secretion/phage lysis holin  41.23 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000653947  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0971  toxin secretion/phage lysis holin  41.24 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.332324  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5852  prophage LambdaBa02, holin, putative  44 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3577  toxin secretion/phage lysis holin  43 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0161092  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0366  toxin secretion/phage lysis holin  39.18 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0370  toxin secretion/phage lysis holin  39.18 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2787  Phage-related holin (Lysis protein)-like protein  42 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3883  toxin secretion/phage lysis holin  32.32 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1280  toxin secretion/phage lysis holin  31 
 
 		 135 aa  60.1  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1331  toxin secretion/phage lysis holin  28.97 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>