31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3883 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3883  toxin secretion/phage lysis holin  100 
 
 		 138 aa  276  6e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1280  toxin secretion/phage lysis holin  41.18 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0370  toxin secretion/phage lysis holin  39.85 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0366  toxin secretion/phage lysis holin  40.6 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2819  toxin secretion/phage lysis holin  38.98 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0971  toxin secretion/phage lysis holin  36.57 
 
 		 138 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.332324  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1487  Phage-related holin  33.81 
 
 		 180 aa  77  0.00000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1612  toxin secretion/phage lysis holin  36.19 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000571336  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0424  toxin secretion/phage lysis holin  36.19 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746936  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1704  toxin secretion/phage lysis holin  36.75 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0414  bacteriophage phi-105 protein-like protein  35.34 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0644  toxin secretion/phage lysis holin  29.93 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1067  toxin secretion/phage lysis holin  33.59 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.896597  normal  0.443941 
 
 
-
 
NC_002936  DET1071  holin  32.2 
 
 		 141 aa  67  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.249678  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1930  toxin secretion/phage lysis holin  38.61 
 
 		 250 aa  67  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0311958  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5852  prophage LambdaBa02, holin, putative  30.43 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1976  toxin secretion/phage lysis holin  32.32 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3491  prophage LambdaBa01, holin  30.43 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000160757  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2945  toxin secretion/phage lysis holin  30.65 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0122062  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3768  prophage lambdaba01, holin  30.43 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3413  toxin secretion/phage lysis holin  30.43 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000505661  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1269  toxin secretion/phage lysis holin  34.95 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3785  prophage LambdaBa02, holin  31.36 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.020072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4074  prophage lambdaba02, holin  31.36 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.124565  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2685  putative prophage LambdaBa02, holin  28.99 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0586  toxin secretion/phage lysis holin  31.58 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2932  toxin secretion/phage lysis holin  29.91 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000653947  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3577  toxin secretion/phage lysis holin  27.54 
 
 		 141 aa  60.1  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0161092  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1331  toxin secretion/phage lysis holin  33.64 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2943  toxin secretion/phage lysis holin  26.53 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0683792  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2787  Phage-related holin (Lysis protein)-like protein  29.69 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>