32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0644 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0644  toxin secretion/phage lysis holin  100 
 
 
137 aa  269  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5852  prophage LambdaBa02, holin, putative  48.91 
 
 
141 aa  142  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3413  toxin secretion/phage lysis holin  47.45 
 
 
141 aa  142  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000505661  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2685  putative prophage LambdaBa02, holin  48.18 
 
 
141 aa  140  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2932  toxin secretion/phage lysis holin  48.87 
 
 
146 aa  140  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000653947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4074  prophage lambdaba02, holin  46.72 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.124565  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3785  prophage LambdaBa02, holin  46.72 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.020072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3768  prophage lambdaba01, holin  46.72 
 
 
141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3491  prophage LambdaBa01, holin  46.72 
 
 
141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000160757  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3577  toxin secretion/phage lysis holin  48.87 
 
 
141 aa  137  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0161092  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2819  toxin secretion/phage lysis holin  50 
 
 
138 aa  125  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0586  toxin secretion/phage lysis holin  51.75 
 
 
131 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1071  holin  46.03 
 
 
141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.249678  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1612  toxin secretion/phage lysis holin  55.66 
 
 
139 aa  111  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000571336  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1487  Phage-related holin  42.06 
 
 
180 aa  110  9e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1704  toxin secretion/phage lysis holin  44.26 
 
 
136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0424  toxin secretion/phage lysis holin  57.01 
 
 
139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746936  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1976  toxin secretion/phage lysis holin  53 
 
 
117 aa  103  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0414  bacteriophage phi-105 protein-like protein  50 
 
 
146 aa  101  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1269  toxin secretion/phage lysis holin  49.02 
 
 
136 aa  100  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0971  toxin secretion/phage lysis holin  37.59 
 
 
138 aa  96.7  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.332324  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2945  toxin secretion/phage lysis holin  40.44 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0122062  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0366  toxin secretion/phage lysis holin  37.4 
 
 
132 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1930  toxin secretion/phage lysis holin  44.66 
 
 
250 aa  87.8  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0311958  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0370  toxin secretion/phage lysis holin  36.64 
 
 
132 aa  85.9  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2787  Phage-related holin (Lysis protein)-like protein  45.45 
 
 
120 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3883  toxin secretion/phage lysis holin  29.93 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1331  toxin secretion/phage lysis holin  30.08 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1280  toxin secretion/phage lysis holin  31.09 
 
 
135 aa  61.2  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0798  toxin secretion/phage lysis holin  32.1 
 
 
160 aa  57.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2943  toxin secretion/phage lysis holin  27.59 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0683792  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1067  toxin secretion/phage lysis holin  26.61 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.896597  normal  0.443941 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>