28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2787 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2787  Phage-related holin (Lysis protein)-like protein  100 
 
 		 120 aa  234  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0586  toxin secretion/phage lysis holin  65 
 
 		 131 aa  103  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2945  toxin secretion/phage lysis holin  39.81 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0122062  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0644  toxin secretion/phage lysis holin  45.45 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2819  toxin secretion/phage lysis holin  40.79 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1704  toxin secretion/phage lysis holin  43.28 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1487  Phage-related holin  41.79 
 
 		 180 aa  70.9  0.000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1976  toxin secretion/phage lysis holin  42 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1071  holin  40.3 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.249678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2685  putative prophage LambdaBa02, holin  36.62 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4074  prophage lambdaba02, holin  38.03 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.124565  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3413  toxin secretion/phage lysis holin  38.03 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000505661  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3768  prophage lambdaba01, holin  38.03 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3785  prophage LambdaBa02, holin  38.03 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.020072  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3491  prophage LambdaBa01, holin  38.03 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000160757  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2932  toxin secretion/phage lysis holin  37.68 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000653947  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1269  toxin secretion/phage lysis holin  43.55 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5852  prophage LambdaBa02, holin, putative  33.8 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3577  toxin secretion/phage lysis holin  36.92 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0161092  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1612  toxin secretion/phage lysis holin  46.3 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000571336  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0424  toxin secretion/phage lysis holin  43.75 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746936  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0971  toxin secretion/phage lysis holin  34.25 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.332324  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1280  toxin secretion/phage lysis holin  33.33 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1930  toxin secretion/phage lysis holin  34.38 
 
 		 250 aa  51.2  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0311958  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0414  bacteriophage phi-105 protein-like protein  37.04 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0370  toxin secretion/phage lysis holin  35.09 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0366  toxin secretion/phage lysis holin  35.09 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3883  toxin secretion/phage lysis holin  29.69 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>