32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0586 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0586  toxin secretion/phage lysis holin  100 
 
 
131 aa  253  5e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0644  toxin secretion/phage lysis holin  51.75 
 
 
137 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5852  prophage LambdaBa02, holin, putative  45.08 
 
 
141 aa  118  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3785  prophage LambdaBa02, holin  43.44 
 
 
141 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.020072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4074  prophage lambdaba02, holin  43.44 
 
 
141 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.124565  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3413  toxin secretion/phage lysis holin  43.44 
 
 
141 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000505661  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3577  toxin secretion/phage lysis holin  44.44 
 
 
141 aa  116  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0161092  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3491  prophage LambdaBa01, holin  43.44 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000160757  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3768  prophage lambdaba01, holin  43.44 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116081  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1487  Phage-related holin  45.69 
 
 
180 aa  115  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2685  putative prophage LambdaBa02, holin  40.98 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1704  toxin secretion/phage lysis holin  45.69 
 
 
136 aa  111  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2819  toxin secretion/phage lysis holin  44.72 
 
 
138 aa  111  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2932  toxin secretion/phage lysis holin  41.67 
 
 
146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000653947  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1071  holin  42.62 
 
 
141 aa  108  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.249678  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1269  toxin secretion/phage lysis holin  51.04 
 
 
136 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2945  toxin secretion/phage lysis holin  47.37 
 
 
137 aa  106  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0122062  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2787  Phage-related holin (Lysis protein)-like protein  65 
 
 
120 aa  103  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1612  toxin secretion/phage lysis holin  50 
 
 
139 aa  103  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000571336  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0414  bacteriophage phi-105 protein-like protein  45.28 
 
 
146 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0424  toxin secretion/phage lysis holin  48.04 
 
 
139 aa  99.4  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746936  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1930  toxin secretion/phage lysis holin  45.83 
 
 
250 aa  93.6  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0311958  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0971  toxin secretion/phage lysis holin  39.66 
 
 
138 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.332324  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1976  toxin secretion/phage lysis holin  46.88 
 
 
117 aa  90.1  8e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0366  toxin secretion/phage lysis holin  36.21 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0370  toxin secretion/phage lysis holin  35.34 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1280  toxin secretion/phage lysis holin  32 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3883  toxin secretion/phage lysis holin  31.58 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2943  toxin secretion/phage lysis holin  32.35 
 
 
155 aa  55.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0683792  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0858  toxin secretion/phage lysis holin  29.6 
 
 
149 aa  53.9  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00163549  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1331  toxin secretion/phage lysis holin  33.03 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0798  toxin secretion/phage lysis holin  31.71 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>