22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0858 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0858  toxin secretion/phage lysis holin  100 
 
 
149 aa  309  6.999999999999999e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00163549  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0586  toxin secretion/phage lysis holin  30.4 
 
 
131 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1331  toxin secretion/phage lysis holin  24.63 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3883  toxin secretion/phage lysis holin  32.38 
 
 
138 aa  50.1  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1487  Phage-related holin  29.57 
 
 
180 aa  48.9  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1612  toxin secretion/phage lysis holin  25.69 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000571336  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1071  holin  24.6 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.249678  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1704  toxin secretion/phage lysis holin  29.17 
 
 
136 aa  48.9  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0414  bacteriophage phi-105 protein-like protein  27.12 
 
 
146 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1269  toxin secretion/phage lysis holin  28.85 
 
 
136 aa  47.4  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0971  toxin secretion/phage lysis holin  29.41 
 
 
138 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.332324  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2932  toxin secretion/phage lysis holin  30.51 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000653947  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1930  toxin secretion/phage lysis holin  28.72 
 
 
250 aa  46.2  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0311958  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0424  toxin secretion/phage lysis holin  25.69 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746936  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0798  toxin secretion/phage lysis holin  28.99 
 
 
160 aa  45.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2945  toxin secretion/phage lysis holin  26.89 
 
 
137 aa  45.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0122062  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1280  toxin secretion/phage lysis holin  28.7 
 
 
135 aa  44.3  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0370  toxin secretion/phage lysis holin  30.21 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2685  putative prophage LambdaBa02, holin  27.59 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3577  toxin secretion/phage lysis holin  26.5 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0161092  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1063  hypothetical protein  31.82 
 
 
512 aa  40.4  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0366  toxin secretion/phage lysis holin  29.47 
 
 
132 aa  40.4  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>