32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1612 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1612  toxin secretion/phage lysis holin  100 
 
 		 139 aa  278  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000571336  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0424  toxin secretion/phage lysis holin  94.24 
 
 		 139 aa  236  5e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746936  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2819  toxin secretion/phage lysis holin  71.74 
 
 		 138 aa  213  5.9999999999999996e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1704  toxin secretion/phage lysis holin  69.57 
 
 		 136 aa  197  6e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1071  holin  66.67 
 
 		 141 aa  194  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.249678  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0414  bacteriophage phi-105 protein-like protein  68.31 
 
 		 146 aa  178  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1487  Phage-related holin  60.63 
 
 		 180 aa  173  8e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1269  toxin secretion/phage lysis holin  65.93 
 
 		 136 aa  173  9e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2945  toxin secretion/phage lysis holin  60.47 
 
 		 137 aa  163  5.9999999999999996e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0122062  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1930  toxin secretion/phage lysis holin  63.2 
 
 		 250 aa  144  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0311958  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1976  toxin secretion/phage lysis holin  50.43 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0644  toxin secretion/phage lysis holin  51.59 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2685  putative prophage LambdaBa02, holin  50.41 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4074  prophage lambdaba02, holin  46.92 
 
 		 141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.124565  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3785  prophage LambdaBa02, holin  46.92 
 
 		 141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.020072  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2932  toxin secretion/phage lysis holin  50.78 
 
 		 146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000653947  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3413  toxin secretion/phage lysis holin  48.78 
 
 		 141 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000505661  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0586  toxin secretion/phage lysis holin  49.56 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3491  prophage LambdaBa01, holin  47.97 
 
 		 141 aa  114  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000160757  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3768  prophage lambdaba01, holin  47.97 
 
 		 141 aa  114  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116081  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5852  prophage LambdaBa02, holin, putative  47.97 
 
 		 141 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0971  toxin secretion/phage lysis holin  42.86 
 
 		 138 aa  111  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.332324  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3577  toxin secretion/phage lysis holin  47.15 
 
 		 141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0161092  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0366  toxin secretion/phage lysis holin  41.35 
 
 		 132 aa  93.6  8e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0370  toxin secretion/phage lysis holin  41.35 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1280  toxin secretion/phage lysis holin  34.96 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3883  toxin secretion/phage lysis holin  33.33 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2787  Phage-related holin (Lysis protein)-like protein  41.18 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1331  toxin secretion/phage lysis holin  27.27 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1067  toxin secretion/phage lysis holin  28.1 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.896597  normal  0.443941 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2943  toxin secretion/phage lysis holin  27.46 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0683792  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0798  toxin secretion/phage lysis holin  28.77 
 
 		 160 aa  40.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>