31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1487 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1487  Phage-related holin  100 
 
 		 180 aa  363  1e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1704  toxin secretion/phage lysis holin  60.9 
 
 		 136 aa  181  7e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2819  toxin secretion/phage lysis holin  62.9 
 
 		 138 aa  166  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1071  holin  57.81 
 
 		 141 aa  160  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.249678  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2945  toxin secretion/phage lysis holin  61.86 
 
 		 137 aa  155  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0122062  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1269  toxin secretion/phage lysis holin  63.3 
 
 		 136 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1612  toxin secretion/phage lysis holin  58.72 
 
 		 139 aa  147  9e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000571336  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0424  toxin secretion/phage lysis holin  59.05 
 
 		 139 aa  143  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0414  bacteriophage phi-105 protein-like protein  55.36 
 
 		 146 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1930  toxin secretion/phage lysis holin  58.82 
 
 		 250 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0311958  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1976  toxin secretion/phage lysis holin  62.63 
 
 		 117 aa  131  6e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2685  putative prophage LambdaBa02, holin  46.27 
 
 		 141 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2932  toxin secretion/phage lysis holin  47.2 
 
 		 146 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000653947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0586  toxin secretion/phage lysis holin  45.69 
 
 		 131 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5852  prophage LambdaBa02, holin, putative  45.86 
 
 		 141 aa  114  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3413  toxin secretion/phage lysis holin  44.78 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000505661  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4074  prophage lambdaba02, holin  47.2 
 
 		 141 aa  112  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.124565  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3785  prophage LambdaBa02, holin  47.2 
 
 		 141 aa  112  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.020072  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3491  prophage LambdaBa01, holin  47.2 
 
 		 141 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000160757  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3768  prophage lambdaba01, holin  47.2 
 
 		 141 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3577  toxin secretion/phage lysis holin  45.24 
 
 		 141 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0161092  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0644  toxin secretion/phage lysis holin  42.06 
 
 		 137 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0971  toxin secretion/phage lysis holin  47.54 
 
 		 138 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.332324  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0366  toxin secretion/phage lysis holin  47.06 
 
 		 132 aa  94  9e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0370  toxin secretion/phage lysis holin  47.06 
 
 		 132 aa  93.6  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1280  toxin secretion/phage lysis holin  34.4 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3883  toxin secretion/phage lysis holin  33.81 
 
 		 138 aa  77  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2787  Phage-related holin (Lysis protein)-like protein  41.79 
 
 		 120 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1331  toxin secretion/phage lysis holin  29.91 
 
 		 142 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2943  toxin secretion/phage lysis holin  28.37 
 
 		 155 aa  48.9  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0683792  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0798  toxin secretion/phage lysis holin  29.13 
 
 		 160 aa  48.1  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>