31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1930 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1930  toxin secretion/phage lysis holin  100 
 
 		 250 aa  490  9.999999999999999e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0311958  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2819  toxin secretion/phage lysis holin  65.6 
 
 		 138 aa  177  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1704  toxin secretion/phage lysis holin  61.36 
 
 		 136 aa  177  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2945  toxin secretion/phage lysis holin  61.9 
 
 		 137 aa  172  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0122062  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1487  Phage-related holin  57.02 
 
 		 180 aa  157  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1071  holin  56.39 
 
 		 141 aa  153  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.249678  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1269  toxin secretion/phage lysis holin  61.68 
 
 		 136 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0424  toxin secretion/phage lysis holin  68.69 
 
 		 139 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746936  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1612  toxin secretion/phage lysis holin  66.67 
 
 		 139 aa  142  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000571336  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0414  bacteriophage phi-105 protein-like protein  60.47 
 
 		 146 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1976  toxin secretion/phage lysis holin  44.83 
 
 		 117 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0586  toxin secretion/phage lysis holin  44.25 
 
 		 131 aa  105  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2932  toxin secretion/phage lysis holin  41.04 
 
 		 146 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000653947  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2685  putative prophage LambdaBa02, holin  42.11 
 
 		 141 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3785  prophage LambdaBa02, holin  42.98 
 
 		 141 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.020072  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0644  toxin secretion/phage lysis holin  41.46 
 
 		 137 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4074  prophage lambdaba02, holin  42.98 
 
 		 141 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.124565  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3413  toxin secretion/phage lysis holin  42.98 
 
 		 141 aa  97.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000505661  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3491  prophage LambdaBa01, holin  42.98 
 
 		 141 aa  95.5  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000160757  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3768  prophage lambdaba01, holin  42.98 
 
 		 141 aa  95.5  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116081  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5852  prophage LambdaBa02, holin, putative  38.98 
 
 		 141 aa  92  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3577  toxin secretion/phage lysis holin  40.35 
 
 		 141 aa  89.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0161092  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0971  toxin secretion/phage lysis holin  33.08 
 
 		 138 aa  85.5  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.332324  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0366  toxin secretion/phage lysis holin  41.32 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0370  toxin secretion/phage lysis holin  42.15 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1280  toxin secretion/phage lysis holin  34.4 
 
 		 135 aa  74.3  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3883  toxin secretion/phage lysis holin  35.96 
 
 		 138 aa  68.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2787  Phage-related holin (Lysis protein)-like protein  34.18 
 
 		 120 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1331  toxin secretion/phage lysis holin  30.77 
 
 		 142 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00995  Protein stu1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BEN5]  26.09 
 
 		 1324 aa  46.2  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.866308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1050  hypothetical protein  21.09 
 
 		 1246 aa  43.5  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>