22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1067 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1067  toxin secretion/phage lysis holin  100 
 
 		 151 aa  308  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.896597  normal  0.443941 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3883  toxin secretion/phage lysis holin  33.59 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1280  toxin secretion/phage lysis holin  27.48 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0644  toxin secretion/phage lysis holin  26.61 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2945  toxin secretion/phage lysis holin  31.62 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0122062  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1704  toxin secretion/phage lysis holin  25.41 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1487  Phage-related holin  26.98 
 
 		 180 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5852  prophage LambdaBa02, holin, putative  31.58 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3785  prophage LambdaBa02, holin  28.21 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.020072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4074  prophage lambdaba02, holin  28.21 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.124565  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2932  toxin secretion/phage lysis holin  26.12 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000653947  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3577  toxin secretion/phage lysis holin  33.33 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0161092  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0971  toxin secretion/phage lysis holin  27.78 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.332324  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0586  toxin secretion/phage lysis holin  23.33 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1003  hypothetical protein  30.68 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1071  holin  24.6 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.249678  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2819  toxin secretion/phage lysis holin  25.4 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3413  toxin secretion/phage lysis holin  27.35 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000505661  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2685  putative prophage LambdaBa02, holin  27.83 
 
 		 141 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3768  prophage lambdaba01, holin  27.35 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3491  prophage LambdaBa01, holin  27.35 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000160757  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1612  toxin secretion/phage lysis holin  28.87 
 
 		 139 aa  40.4  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000571336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>