76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1240 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1240  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  387  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1340  hypothetical protein  87.3 
 
 		 189 aa  350  7e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.000123504 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1135  hypothetical protein  73.12 
 
 		 185 aa  288  4e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.616749  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2845  hypothetical protein  62.84 
 
 		 185 aa  278  4e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3016  hypothetical protein  70.97 
 
 		 186 aa  269  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842441  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3174  hypothetical protein  70.97 
 
 		 186 aa  269  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00025899  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1347  hypothetical protein  70.97 
 
 		 186 aa  269  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000908641  hitchhiker  0.0000000000414512 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3031  hypothetical protein  70.97 
 
 		 186 aa  267  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3343  hypothetical protein  70.43 
 
 		 186 aa  267  7e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1203  hypothetical protein  70.43 
 
 		 186 aa  267  8e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.063894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1273  hypothetical protein  70.43 
 
 		 186 aa  266  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000675373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1202  hypothetical protein  70.43 
 
 		 186 aa  266  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0005069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1147  hypothetical protein  72.73 
 
 		 187 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00658881  normal  0.0364761 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2678  hypothetical protein  68.28 
 
 		 186 aa  259  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.019239  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2469  hypothetical protein  65.05 
 
 		 186 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2676  hypothetical protein  59.34 
 
 		 185 aa  251  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000868105  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0469  hypothetical protein  35.39 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07240  hypothetical protein  34.86 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0639  putative lipoprotein  27.66 
 
 		 188 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0346116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4076  hypothetical protein  35.98 
 
 		 186 aa  87.8  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1843  conserved hypothetical protein, secreted  30.85 
 
 		 176 aa  85.5  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.547906  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1605  hypothetical protein  31.41 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0615  hypothetical protein  28.49 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1006  hypothetical protein  28.25 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.230842 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1660  hypothetical protein  28.41 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.715972  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0738  lipoprotein, putative  27.81 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1478  hypothetical protein  30.21 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.840474  normal  0.345122 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1947  putative lipoprotein  28.09 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779715 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0738  hypothetical protein  27.33 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1907  hypothetical protein  32.54 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905779  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4588  lipoprotein  30.81 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0554174 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1528  hypothetical protein  27.84 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1146  hypothetical protein  29.47 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0576  putative lipoprotein  29.82 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0621  lipoprotein  29.82 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304887 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00590  putative lipoprotein  28.98 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.966617  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2866  hypothetical protein  25.97 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63340  putative lipoprotein  26.6 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0331775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5515  putative lipoprotein  26.6 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4152  putative lipoprotein  29.1 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1595  hypothetical protein  26.67 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515991  normal  0.107651 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2803  hypothetical protein  27.84 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.316903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0635  putative lipoprotein  26.79 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05585  hypothetical protein  28.57 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1068  hypothetical protein  28.02 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000510345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1101  hypothetical protein  28.02 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  normal  0.0488625 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0999  hypothetical protein  27.87 
 
 		 178 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000998217  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3290  hypothetical protein  27.32 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000451719  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06158  hypothetical protein  24.86 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6525  hypothetical protein  22.22 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0406  putative lipoprotein  23.67 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1735  hypothetical protein  24.86 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.428969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000348  hypothetical protein  24.44 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3161  hypothetical protein  25.14 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4738  hypothetical protein  25.29 
 
 		 185 aa  52.4  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00940  hypothetical protein  27.27 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.292932  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3009  hypothetical protein  27.17 
 
 		 178 aa  51.2  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  normal  0.0687233 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3187  hypothetical protein  26.63 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00707615  normal  0.59429 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0978  hypothetical protein  26.44 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1444  putative lipoprotein  23.53 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0676228  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6323  putative lipoprotein  27.91 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3090  hypothetical protein  27.17 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00239332  normal  0.428293 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3597  hypothetical protein  26.09 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3234  putative lipoprotein  24.06 
 
 		 192 aa  48.5  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.104755  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1107  hypothetical protein  21.69 
 
 		 184 aa  48.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138586 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4587  lipoprotein  22.89 
 
 		 211 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1027  hypothetical protein  23.53 
 
 		 179 aa  45.1  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000130627  normal  0.110707 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1007  hypothetical protein  26.74 
 
 		 178 aa  44.7  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613639  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3639  lipoprotein  22.56 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.171802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0498  putative lipoprotein  25.27 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3472  hypothetical protein  21.13 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000238843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0893  hypothetical protein  25.13 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000267629  normal  0.854423 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0622  hypothetical protein  33.9 
 
 		 211 aa  42  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0577  hypothetical protein  33.9 
 
 		 231 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.603488 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0616  hypothetical protein  33.9 
 
 		 211 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145127  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1577  hypothetical protein  20.79 
 
 		 191 aa  41.2  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>