28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3472 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3472  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  371  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000238843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3639  lipoprotein  52.69 
 
 		 191 aa  189  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.171802 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1947  putative lipoprotein  27.37 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779715 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1595  hypothetical protein  23.78 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515991  normal  0.107651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1444  putative lipoprotein  23.78 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0676228  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06158  hypothetical protein  24.86 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00590  putative lipoprotein  28.66 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.966617  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1843  conserved hypothetical protein, secreted  28.73 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.547906  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3161  hypothetical protein  22.87 
 
 		 191 aa  47.8  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3343  hypothetical protein  24.04 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1340  hypothetical protein  19.39 
 
 		 189 aa  45.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.000123504 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2678  hypothetical protein  24.18 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.019239  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2845  hypothetical protein  22.73 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0498  putative lipoprotein  21.99 
 
 		 187 aa  45.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1605  hypothetical protein  20.51 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2676  hypothetical protein  20 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000868105  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1240  hypothetical protein  21.13 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1273  hypothetical protein  22.4 
 
 		 186 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000675373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1202  hypothetical protein  22.4 
 
 		 186 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0005069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1347  hypothetical protein  22.4 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000908641  hitchhiker  0.0000000000414512 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3174  hypothetical protein  22.4 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00025899  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1907  hypothetical protein  28.75 
 
 		 178 aa  42  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905779  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1146  hypothetical protein  26.92 
 
 		 192 aa  42  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3016  hypothetical protein  22.4 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842441  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0738  hypothetical protein  22.1 
 
 		 184 aa  42  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1203  hypothetical protein  22.4 
 
 		 186 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.063894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3187  hypothetical protein  29.21 
 
 		 178 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00707615  normal  0.59429 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3031  hypothetical protein  22.4 
 
 		 186 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>