38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3161 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3161  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  400  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6525  hypothetical protein  43.43 
 
 		 189 aa  174  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1146  hypothetical protein  26.04 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1006  hypothetical protein  25.14 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.230842 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1947  putative lipoprotein  23.5 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779715 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1240  hypothetical protein  25.14 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2845  hypothetical protein  22.35 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2469  hypothetical protein  22.91 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07240  hypothetical protein  26.59 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2678  hypothetical protein  25.79 
 
 		 186 aa  53.9  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.019239  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1135  hypothetical protein  25.68 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.616749  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1595  hypothetical protein  23.81 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515991  normal  0.107651 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2676  hypothetical protein  21.47 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000868105  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1907  hypothetical protein  27.22 
 
 		 178 aa  52.4  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905779  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00590  putative lipoprotein  22.81 
 
 		 183 aa  51.2  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.966617  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1605  hypothetical protein  21.83 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3343  hypothetical protein  23.46 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1203  hypothetical protein  23.68 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.063894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0615  hypothetical protein  23.46 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1273  hypothetical protein  23.68 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000675373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1202  hypothetical protein  23.68 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0005069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0639  putative lipoprotein  22.34 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0346116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1478  hypothetical protein  24.44 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.840474  normal  0.345122 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1340  hypothetical protein  23.46 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.000123504 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1660  hypothetical protein  22.73 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.715972  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4588  lipoprotein  24.28 
 
 		 189 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0554174 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3472  hypothetical protein  22.87 
 
 		 177 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000238843  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0469  hypothetical protein  23.21 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1347  hypothetical protein  20.79 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000908641  hitchhiker  0.0000000000414512 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3174  hypothetical protein  20.79 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00025899  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3016  hypothetical protein  20.79 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842441  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0576  putative lipoprotein  23.7 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3371  hypothetical protein  25.81 
 
 		 179 aa  45.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3031  hypothetical protein  20.79 
 
 		 186 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1528  hypothetical protein  22.22 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0621  lipoprotein  23.7 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6323  putative lipoprotein  20.43 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3234  putative lipoprotein  18.5 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.104755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>