34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0498 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0498  putative lipoprotein  100 
 
 		 187 aa  387  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3371  hypothetical protein  32.94 
 
 		 179 aa  93.6  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1947  putative lipoprotein  27.6 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779715 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1595  hypothetical protein  29.19 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515991  normal  0.107651 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1528  hypothetical protein  29.21 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1843  conserved hypothetical protein, secreted  27.42 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.547906  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1444  putative lipoprotein  29.48 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0676228  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1146  hypothetical protein  24.74 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1478  hypothetical protein  23.4 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.840474  normal  0.345122 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3174  hypothetical protein  25.81 
 
 		 186 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00025899  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1202  hypothetical protein  26.88 
 
 		 186 aa  47.8  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0005069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1273  hypothetical protein  26.88 
 
 		 186 aa  47.8  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000675373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1347  hypothetical protein  25.81 
 
 		 186 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000908641  hitchhiker  0.0000000000414512 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3016  hypothetical protein  25.81 
 
 		 186 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842441  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1203  hypothetical protein  26.34 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.063894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0615  hypothetical protein  22.4 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00590  putative lipoprotein  24.22 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.966617  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1340  hypothetical protein  25.91 
 
 		 189 aa  45.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.000123504 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3343  hypothetical protein  25.81 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3031  hypothetical protein  25.27 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0621  lipoprotein  22.28 
 
 		 189 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304887 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2845  hypothetical protein  23.96 
 
 		 185 aa  45.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3472  hypothetical protein  21.99 
 
 		 177 aa  45.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000238843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1660  hypothetical protein  23.03 
 
 		 195 aa  45.1  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.715972  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1240  hypothetical protein  25.27 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4588  lipoprotein  22.16 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0554174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0576  putative lipoprotein  22.4 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2678  hypothetical protein  24.19 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.019239  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0469  hypothetical protein  25.82 
 
 		 174 aa  42.4  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1135  hypothetical protein  21.98 
 
 		 185 aa  42  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.616749  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6525  hypothetical protein  23.26 
 
 		 189 aa  41.6  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0406  putative lipoprotein  25.62 
 
 		 178 aa  42  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2469  hypothetical protein  25.26 
 
 		 186 aa  41.6  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0639  putative lipoprotein  23.28 
 
 		 188 aa  41.2  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0346116  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>