75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1340 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1340  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.000123504 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1240  hypothetical protein  87.3 
 
 		 186 aa  350  7e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1135  hypothetical protein  73.54 
 
 		 185 aa  284  4e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.616749  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2845  hypothetical protein  63.39 
 
 		 185 aa  276  9e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2676  hypothetical protein  62.09 
 
 		 185 aa  260  6.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000868105  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3174  hypothetical protein  68.82 
 
 		 186 aa  259  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00025899  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1347  hypothetical protein  68.82 
 
 		 186 aa  259  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000908641  hitchhiker  0.0000000000414512 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3016  hypothetical protein  68.82 
 
 		 186 aa  259  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842441  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1147  hypothetical protein  71.12 
 
 		 187 aa  259  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00658881  normal  0.0364761 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3031  hypothetical protein  68.82 
 
 		 186 aa  258  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3343  hypothetical protein  68.28 
 
 		 186 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1203  hypothetical protein  67.74 
 
 		 186 aa  257  6e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.063894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1202  hypothetical protein  67.74 
 
 		 186 aa  256  9e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0005069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1273  hypothetical protein  67.74 
 
 		 186 aa  256  9e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000675373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2469  hypothetical protein  66.14 
 
 		 186 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2678  hypothetical protein  65.05 
 
 		 186 aa  248  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.019239  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0469  hypothetical protein  35.75 
 
 		 174 aa  104  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07240  hypothetical protein  34.66 
 
 		 181 aa  101  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0639  putative lipoprotein  30.6 
 
 		 188 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0346116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1478  hypothetical protein  31.25 
 
 		 189 aa  88.2  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.840474  normal  0.345122 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1947  putative lipoprotein  29.51 
 
 		 188 aa  86.3  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779715 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1006  hypothetical protein  29.23 
 
 		 196 aa  85.5  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.230842 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1843  conserved hypothetical protein, secreted  29.79 
 
 		 176 aa  84.7  8e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.547906  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0738  lipoprotein, putative  29.41 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1605  hypothetical protein  31.15 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0615  hypothetical protein  31.35 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4076  hypothetical protein  32.58 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1660  hypothetical protein  25.84 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.715972  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1146  hypothetical protein  30.69 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0738  hypothetical protein  27.33 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0576  putative lipoprotein  30.99 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0621  lipoprotein  30.99 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304887 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1907  hypothetical protein  32.54 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905779  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4588  lipoprotein  30.23 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0554174 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1528  hypothetical protein  28.5 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00590  putative lipoprotein  27.08 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.966617  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2866  hypothetical protein  26.26 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5515  putative lipoprotein  29.14 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63340  putative lipoprotein  29.14 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0331775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0635  putative lipoprotein  27.38 
 
 		 185 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6525  hypothetical protein  22.58 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0406  putative lipoprotein  25.44 
 
 		 178 aa  67  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1595  hypothetical protein  25.82 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515991  normal  0.107651 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06158  hypothetical protein  25.95 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2803  hypothetical protein  26.14 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.316903  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4152  putative lipoprotein  26.98 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3290  hypothetical protein  27.23 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000451719  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1735  hypothetical protein  26.67 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.428969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0999  hypothetical protein  27.23 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000998217  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000348  hypothetical protein  24.44 
 
 		 172 aa  53.9  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1107  hypothetical protein  23.53 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138586 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05585  hypothetical protein  26.49 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1101  hypothetical protein  27.37 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  normal  0.0488625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1068  hypothetical protein  27.37 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000510345  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00940  hypothetical protein  26.32 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.292932  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3234  putative lipoprotein  26.78 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.104755  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6323  putative lipoprotein  30.46 
 
 		 189 aa  51.2  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4587  lipoprotein  23.03 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3161  hypothetical protein  23.46 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1444  putative lipoprotein  24.26 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0676228  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4738  hypothetical protein  25.58 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3009  hypothetical protein  27.08 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  normal  0.0687233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3639  lipoprotein  23.12 
 
 		 191 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.171802 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0978  hypothetical protein  26.7 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0498  putative lipoprotein  25.91 
 
 		 187 aa  45.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3472  hypothetical protein  19.39 
 
 		 177 aa  45.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000238843  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3597  hypothetical protein  24.73 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3187  hypothetical protein  26.23 
 
 		 178 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00707615  normal  0.59429 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3090  hypothetical protein  27.08 
 
 		 175 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00239332  normal  0.428293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0622  hypothetical protein  23.64 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113849 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1027  hypothetical protein  24.21 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000130627  normal  0.110707 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0934  hypothetical protein  25.14 
 
 		 192 aa  42  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5514  hypothetical protein  24.85 
 
 		 206 aa  41.6  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0577  hypothetical protein  35.59 
 
 		 231 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.603488 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0616  hypothetical protein  35.59 
 
 		 211 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145127  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>