66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0406 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0406  putative lipoprotein  100 
 
 		 178 aa  361  3e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0469  hypothetical protein  43.83 
 
 		 174 aa  154  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1203  hypothetical protein  28.72 
 
 		 186 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.063894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1273  hypothetical protein  28.72 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000675373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1202  hypothetical protein  28.72 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0005069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1340  hypothetical protein  26.63 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.000123504 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2676  hypothetical protein  30.51 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000868105  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3343  hypothetical protein  26.74 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3016  hypothetical protein  24.86 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842441  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2469  hypothetical protein  27.53 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1347  hypothetical protein  24.86 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000908641  hitchhiker  0.0000000000414512 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3174  hypothetical protein  24.86 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00025899  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2845  hypothetical protein  25.14 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3031  hypothetical protein  24.86 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1135  hypothetical protein  26.67 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.616749  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2678  hypothetical protein  25.95 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.019239  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1240  hypothetical protein  24.44 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07240  hypothetical protein  26.9 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06158  hypothetical protein  32.16 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1478  hypothetical protein  28.73 
 
 		 189 aa  67  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.840474  normal  0.345122 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0639  putative lipoprotein  25 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0346116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1006  hypothetical protein  26.4 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.230842 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0738  hypothetical protein  26.79 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5515  putative lipoprotein  26.16 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000348  hypothetical protein  31.03 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1528  hypothetical protein  25.97 
 
 		 201 aa  62  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63340  putative lipoprotein  25.58 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0331775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1907  hypothetical protein  23.84 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905779  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0635  putative lipoprotein  28.05 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1947  putative lipoprotein  26.97 
 
 		 188 aa  60.8  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779715 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1843  conserved hypothetical protein, secreted  27.81 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.547906  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00590  putative lipoprotein  24.71 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.966617  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1660  hypothetical protein  22.95 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.715972  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1146  hypothetical protein  24.29 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4076  hypothetical protein  26.16 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0615  hypothetical protein  25.7 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1147  hypothetical protein  21.35 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00658881  normal  0.0364761 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0738  lipoprotein, putative  25.45 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0640  putative lipoprotein  29.45 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.508137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0621  lipoprotein  24.12 
 
 		 189 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304887 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1605  hypothetical protein  22.22 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0576  putative lipoprotein  23.53 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0739  lipoprotein, putative  26.99 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6525  hypothetical protein  24.57 
 
 		 189 aa  49.3  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1107  hypothetical protein  25.28 
 
 		 184 aa  48.9  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3639  lipoprotein  24.58 
 
 		 191 aa  48.5  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.171802 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4588  lipoprotein  23.26 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0554174 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1101  hypothetical protein  24.42 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  normal  0.0488625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1068  hypothetical protein  24.42 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000510345  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2866  hypothetical protein  25.43 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1577  hypothetical protein  25.68 
 
 		 191 aa  45.4  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0616  hypothetical protein  26.74 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145127  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3234  putative lipoprotein  24.85 
 
 		 192 aa  45.4  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.104755  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1595  hypothetical protein  25 
 
 		 194 aa  45.1  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515991  normal  0.107651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0634  putative lipoprotein  26.83 
 
 		 203 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1444  putative lipoprotein  21.08 
 
 		 191 aa  44.3  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0676228  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0999  hypothetical protein  23.84 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000998217  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0498  putative lipoprotein  25.56 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0577  hypothetical protein  25.15 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.603488 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0622  hypothetical protein  25.15 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113849 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3290  hypothetical protein  23.26 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000451719  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0739  hypothetical protein  23.2 
 
 		 193 aa  41.6  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0978  hypothetical protein  22.36 
 
 		 196 aa  41.6  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0934  hypothetical protein  22.84 
 
 		 192 aa  41.6  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63320  hypothetical protein  27.74 
 
 		 206 aa  41.2  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5514  hypothetical protein  28.39 
 
 		 206 aa  40.8  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>