48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1528 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1528  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1660  hypothetical protein  33.33 
 
 		 195 aa  111  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.715972  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1006  hypothetical protein  34.64 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.230842 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1478  hypothetical protein  39.46 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.840474  normal  0.345122 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2678  hypothetical protein  28.04 
 
 		 186 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.019239  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3174  hypothetical protein  28.04 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00025899  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1347  hypothetical protein  28.04 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000908641  hitchhiker  0.0000000000414512 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3016  hypothetical protein  28.04 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842441  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1273  hypothetical protein  28.57 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000675373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1202  hypothetical protein  28.57 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0005069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2469  hypothetical protein  27.42 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3031  hypothetical protein  28.04 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1203  hypothetical protein  28.57 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.063894  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3343  hypothetical protein  27.47 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1135  hypothetical protein  26.53 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.616749  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1605  hypothetical protein  27 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2845  hypothetical protein  27.81 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1240  hypothetical protein  27.84 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2676  hypothetical protein  27.69 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000868105  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1340  hypothetical protein  28.5 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.000123504 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1147  hypothetical protein  26.14 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00658881  normal  0.0364761 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0615  hypothetical protein  27.93 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0621  lipoprotein  28.74 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0576  putative lipoprotein  28.16 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0639  putative lipoprotein  26.4 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0346116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1595  hypothetical protein  29.26 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515991  normal  0.107651 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4588  lipoprotein  27.01 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0554174 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1947  putative lipoprotein  29.26 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779715 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0498  putative lipoprotein  29.21 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1843  conserved hypothetical protein, secreted  25.25 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.547906  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1444  putative lipoprotein  30.12 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0676228  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07240  hypothetical protein  29.28 
 
 		 181 aa  57  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4076  hypothetical protein  26.26 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00590  putative lipoprotein  23.7 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.966617  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1907  hypothetical protein  25.28 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905779  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0469  hypothetical protein  24.59 
 
 		 174 aa  54.3  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6525  hypothetical protein  23.91 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0406  putative lipoprotein  25.29 
 
 		 178 aa  52  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63340  putative lipoprotein  27.63 
 
 		 187 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0331775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0635  putative lipoprotein  24.85 
 
 		 185 aa  52  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5515  putative lipoprotein  26.97 
 
 		 187 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0738  lipoprotein, putative  26.26 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1146  hypothetical protein  23.24 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3371  hypothetical protein  28.91 
 
 		 179 aa  49.7  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2866  hypothetical protein  24.04 
 
 		 175 aa  48.5  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1107  hypothetical protein  23.62 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138586 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0738  hypothetical protein  21.39 
 
 		 184 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3161  hypothetical protein  22.22 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>