24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3639 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3639  lipoprotein  100 
 
 		 191 aa  397  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.171802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3472  hypothetical protein  52.69 
 
 		 177 aa  189  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000238843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1947  putative lipoprotein  29.38 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779715 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1595  hypothetical protein  28.71 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515991  normal  0.107651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1444  putative lipoprotein  28.31 
 
 		 191 aa  57  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0676228  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1843  conserved hypothetical protein, secreted  24.46 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.547906  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0469  hypothetical protein  22.62 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00590  putative lipoprotein  26.44 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.966617  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2866  hypothetical protein  23.43 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1340  hypothetical protein  23.12 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.000123504 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0639  putative lipoprotein  23.32 
 
 		 188 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0346116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1660  hypothetical protein  24.84 
 
 		 195 aa  45.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.715972  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2676  hypothetical protein  24.86 
 
 		 185 aa  44.7  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000868105  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2469  hypothetical protein  24.37 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3343  hypothetical protein  25.15 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3371  hypothetical protein  26.16 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1347  hypothetical protein  24.28 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000908641  hitchhiker  0.0000000000414512 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3174  hypothetical protein  24.28 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00025899  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1240  hypothetical protein  22.56 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3016  hypothetical protein  24.28 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842441  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3031  hypothetical protein  24.28 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2678  hypothetical protein  22.46 
 
 		 186 aa  42.4  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.019239  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1147  hypothetical protein  26.92 
 
 		 187 aa  41.6  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00658881  normal  0.0364761 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0893  hypothetical protein  25.82 
 
 		 179 aa  41.6  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000267629  normal  0.854423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>