78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0738 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0738  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  368  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07240  hypothetical protein  66.47 
 
 		 181 aa  228  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0639  putative lipoprotein  57.45 
 
 		 188 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0346116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5515  putative lipoprotein  69.36 
 
 		 187 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63340  putative lipoprotein  69.36 
 
 		 187 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0331775  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0738  lipoprotein, putative  61.99 
 
 		 187 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0615  hypothetical protein  64.67 
 
 		 189 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4588  lipoprotein  66.86 
 
 		 189 aa  198  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0554174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0576  putative lipoprotein  66.86 
 
 		 189 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0621  lipoprotein  66.27 
 
 		 189 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304887 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0635  putative lipoprotein  66.06 
 
 		 185 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2845  hypothetical protein  34.22 
 
 		 185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1135  hypothetical protein  33.87 
 
 		 185 aa  104  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.616749  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1240  hypothetical protein  28.49 
 
 		 186 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2676  hypothetical protein  29.95 
 
 		 185 aa  99.4  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000868105  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1340  hypothetical protein  28.57 
 
 		 189 aa  97.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.000123504 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2469  hypothetical protein  34.76 
 
 		 186 aa  97.1  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4587  lipoprotein  36.69 
 
 		 211 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1202  hypothetical protein  31.22 
 
 		 186 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0005069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1273  hypothetical protein  31.22 
 
 		 186 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000675373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1843  conserved hypothetical protein, secreted  29.12 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.547906  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3343  hypothetical protein  31.02 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1203  hypothetical protein  30.69 
 
 		 186 aa  88.6  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.063894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1347  hypothetical protein  31.55 
 
 		 186 aa  88.2  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000908641  hitchhiker  0.0000000000414512 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3174  hypothetical protein  31.55 
 
 		 186 aa  88.2  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00025899  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3016  hypothetical protein  31.55 
 
 		 186 aa  88.2  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842441  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3031  hypothetical protein  31.55 
 
 		 186 aa  87.8  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2678  hypothetical protein  31.55 
 
 		 186 aa  87.4  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.019239  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0469  hypothetical protein  26.29 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0616  hypothetical protein  39.05 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5514  hypothetical protein  36.42 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0577  hypothetical protein  37.87 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.603488 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63320  hypothetical protein  36.42 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1006  hypothetical protein  27.91 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.230842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0622  hypothetical protein  36.69 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113849 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1146  hypothetical protein  27.37 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1147  hypothetical protein  27.17 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00658881  normal  0.0364761 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0739  hypothetical protein  37.04 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1660  hypothetical protein  27.53 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.715972  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1478  hypothetical protein  29.57 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.840474  normal  0.345122 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07250  lipoprotein  30.72 
 
 		 201 aa  67  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1947  putative lipoprotein  28.87 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0640  putative lipoprotein  34.73 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.508137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06158  hypothetical protein  28.57 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000348  hypothetical protein  28.16 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0739  lipoprotein, putative  33.53 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6525  hypothetical protein  27.47 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0406  putative lipoprotein  27.11 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0959  hypothetical protein  23.53 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000203172  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0634  putative lipoprotein  33.13 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1595  hypothetical protein  26.84 
 
 		 194 aa  60.8  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515991  normal  0.107651 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2866  hypothetical protein  25.95 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3290  hypothetical protein  27.42 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000451719  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00590  putative lipoprotein  25.57 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.966617  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1528  hypothetical protein  24.73 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4152  putative lipoprotein  24.6 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1101  hypothetical protein  27.57 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  normal  0.0488625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1068  hypothetical protein  27.57 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000510345  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00940  hypothetical protein  24.32 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.292932  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0999  hypothetical protein  26.88 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000998217  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1907  hypothetical protein  27.75 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905779  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0893  hypothetical protein  29.08 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000267629  normal  0.854423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4076  hypothetical protein  25 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0978  hypothetical protein  25.47 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0934  hypothetical protein  25.28 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0498  putative lipoprotein  26.4 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3090  hypothetical protein  27.32 
 
 		 175 aa  48.1  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00239332  normal  0.428293 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3009  hypothetical protein  29.03 
 
 		 178 aa  47.8  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  normal  0.0687233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6323  putative lipoprotein  23.35 
 
 		 189 aa  47.8  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1007  hypothetical protein  27.27 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613639  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2803  hypothetical protein  25.61 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.316903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3187  hypothetical protein  28.88 
 
 		 178 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00707615  normal  0.59429 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05585  hypothetical protein  23.91 
 
 		 173 aa  45.1  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3597  hypothetical protein  26.67 
 
 		 178 aa  44.7  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3472  hypothetical protein  22.87 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000238843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1605  hypothetical protein  23.08 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1107  hypothetical protein  20 
 
 		 184 aa  42  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138586 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2105  hypothetical protein  30.43 
 
 		 206 aa  41.6  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>