44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4587 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4587  lipoprotein  100 
 
 		 211 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0622  hypothetical protein  89.1 
 
 		 211 aa  304  7e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0577  hypothetical protein  86.73 
 
 		 231 aa  295  5e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.603488 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0616  hypothetical protein  86.73 
 
 		 211 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0634  putative lipoprotein  62.44 
 
 		 203 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0739  lipoprotein, putative  56.94 
 
 		 212 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0640  putative lipoprotein  57.41 
 
 		 212 aa  191  9e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.508137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0739  hypothetical protein  54.15 
 
 		 193 aa  161  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63320  hypothetical protein  49.51 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5514  hypothetical protein  49.02 
 
 		 206 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07250  lipoprotein  44.62 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07240  hypothetical protein  34.68 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0639  putative lipoprotein  32.13 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0346116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0615  hypothetical protein  31.48 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5515  putative lipoprotein  37.08 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63340  putative lipoprotein  36.52 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0331775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0738  hypothetical protein  35.5 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0738  lipoprotein, putative  33.14 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0576  putative lipoprotein  30.69 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2469  hypothetical protein  27.19 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2845  hypothetical protein  24.88 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4588  lipoprotein  29.7 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0554174 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0621  lipoprotein  29.7 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304887 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1340  hypothetical protein  23.16 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.000123504 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1135  hypothetical protein  25.94 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.616749  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0635  putative lipoprotein  29.5 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1240  hypothetical protein  22.7 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2676  hypothetical protein  23.63 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000868105  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3343  hypothetical protein  23.92 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1273  hypothetical protein  23.44 
 
 		 186 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000675373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1202  hypothetical protein  23.44 
 
 		 186 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0005069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1147  hypothetical protein  22.73 
 
 		 187 aa  52  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00658881  normal  0.0364761 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1203  hypothetical protein  23.44 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.063894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3174  hypothetical protein  23.44 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00025899  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3016  hypothetical protein  23.44 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842441  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1347  hypothetical protein  23.44 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000908641  hitchhiker  0.0000000000414512 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0469  hypothetical protein  22.22 
 
 		 174 aa  49.7  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6525  hypothetical protein  26.95 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3031  hypothetical protein  23.44 
 
 		 186 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2678  hypothetical protein  25 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.019239  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2866  hypothetical protein  25.48 
 
 		 175 aa  49.3  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1478  hypothetical protein  26.95 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.840474  normal  0.345122 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0406  putative lipoprotein  25.29 
 
 		 178 aa  43.9  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1595  hypothetical protein  25.88 
 
 		 194 aa  42.4  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515991  normal  0.107651 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>