25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_07250 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



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Replicon accession

Locus tag

Product

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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_07250  lipoprotein  100 
 
 
201 aa  399  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0634  putative lipoprotein  48.21 
 
 
203 aa  142  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0739  hypothetical protein  47.03 
 
 
193 aa  139  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0739  lipoprotein, putative  44.39 
 
 
212 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4587  lipoprotein  44.1 
 
 
211 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0640  putative lipoprotein  43.08 
 
 
212 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.508137  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0622  hypothetical protein  43.54 
 
 
211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0113849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0577  hypothetical protein  42.58 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.603488 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0616  hypothetical protein  42.58 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145127  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63320  hypothetical protein  43.08 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.382346  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5514  hypothetical protein  42.56 
 
 
206 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07240  hypothetical protein  30.91 
 
 
181 aa  62.4  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0639  putative lipoprotein  25.58 
 
 
188 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0346116  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0615  hypothetical protein  27.62 
 
 
189 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157882  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0738  lipoprotein, putative  29.7 
 
 
187 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4588  lipoprotein  29.81 
 
 
189 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0554174 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0621  lipoprotein  29.81 
 
 
189 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0304887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0576  putative lipoprotein  29.81 
 
 
189 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63340  putative lipoprotein  28.66 
 
 
187 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0331775  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0738  hypothetical protein  29.88 
 
 
184 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0635  putative lipoprotein  26.99 
 
 
185 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5515  putative lipoprotein  28.66 
 
 
187 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1146  hypothetical protein  22.98 
 
 
192 aa  50.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0469  hypothetical protein  25.16 
 
 
174 aa  45.1  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2469  hypothetical protein  22.86 
 
 
186 aa  41.2  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal 
 
 
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