33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0634 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0634  putative lipoprotein  100 
 
 		 203 aa  411  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0640  putative lipoprotein  60.85 
 
 		 212 aa  221  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.508137  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0739  lipoprotein, putative  62.69 
 
 		 212 aa  218  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4587  lipoprotein  64.29 
 
 		 211 aa  204  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0577  hypothetical protein  61.95 
 
 		 231 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.603488 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0622  hypothetical protein  61.95 
 
 		 211 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113849 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0616  hypothetical protein  61.46 
 
 		 211 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0739  hypothetical protein  54.87 
 
 		 193 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07250  lipoprotein  47.85 
 
 		 201 aa  151  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63320  hypothetical protein  50.27 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5514  hypothetical protein  50.27 
 
 		 206 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0639  putative lipoprotein  33.74 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0346116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63340  putative lipoprotein  36.02 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0331775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5515  putative lipoprotein  36.02 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0738  lipoprotein, putative  32.73 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07240  hypothetical protein  34.13 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0615  hypothetical protein  32.2 
 
 		 189 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0635  putative lipoprotein  36.25 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0576  putative lipoprotein  34.16 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0621  lipoprotein  33.54 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4588  lipoprotein  32.92 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0554174 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0738  hypothetical protein  33.74 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0406  putative lipoprotein  29.27 
 
 		 178 aa  54.3  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2866  hypothetical protein  30.13 
 
 		 175 aa  51.2  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0469  hypothetical protein  21.94 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3343  hypothetical protein  27.5 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1273  hypothetical protein  26.88 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000675373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1202  hypothetical protein  26.88 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0005069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1203  hypothetical protein  26.88 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.063894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1135  hypothetical protein  25 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.616749  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0498  putative lipoprotein  26.76 
 
 		 187 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2678  hypothetical protein  24.84 
 
 		 186 aa  42.7  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.019239  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2469  hypothetical protein  26.88 
 
 		 186 aa  42.4  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>