27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0739 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0739  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0640  putative lipoprotein  52.13 
 
 		 212 aa  158  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.508137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4587  lipoprotein  55.38 
 
 		 211 aa  157  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0634  putative lipoprotein  53.85 
 
 		 203 aa  155  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0739  lipoprotein, putative  52.91 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0616  hypothetical protein  50.24 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145127  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0577  hypothetical protein  49.76 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.603488 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0622  hypothetical protein  49.27 
 
 		 211 aa  144  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113849 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07250  lipoprotein  48.13 
 
 		 201 aa  139  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63320  hypothetical protein  48.39 
 
 		 206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5514  hypothetical protein  47.85 
 
 		 206 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07240  hypothetical protein  32.32 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5515  putative lipoprotein  33.96 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0635  putative lipoprotein  34.18 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0738  hypothetical protein  33.12 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0639  putative lipoprotein  28.97 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0346116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63340  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0331775  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0738  lipoprotein, putative  31.14 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0615  hypothetical protein  27.96 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157882  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0576  putative lipoprotein  29.63 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0621  lipoprotein  29.01 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4588  lipoprotein  29.56 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0554174 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0469  hypothetical protein  24.5 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6525  hypothetical protein  24.24 
 
 		 189 aa  45.1  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2845  hypothetical protein  21.76 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0406  putative lipoprotein  24.84 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1735  hypothetical protein  23.84 
 
 		 175 aa  41.6  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.428969  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>