33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_63320 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_63320  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  407  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5514  hypothetical protein  95.72 
 
 		 206 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0640  putative lipoprotein  48.11 
 
 		 212 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.508137  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0739  lipoprotein, putative  47.32 
 
 		 212 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4587  lipoprotein  52.02 
 
 		 211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0622  hypothetical protein  51.4 
 
 		 211 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113849 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0616  hypothetical protein  51.4 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145127  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0577  hypothetical protein  50.93 
 
 		 231 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.603488 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0739  hypothetical protein  48.26 
 
 		 193 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0634  putative lipoprotein  48.73 
 
 		 203 aa  125  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07250  lipoprotein  43.39 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07240  hypothetical protein  38.27 
 
 		 181 aa  102  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0738  lipoprotein, putative  38.41 
 
 		 187 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0639  putative lipoprotein  38.18 
 
 		 188 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0346116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0635  putative lipoprotein  39.13 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0615  hypothetical protein  39.88 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157882  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0576  putative lipoprotein  39.88 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0621  lipoprotein  39.26 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304887 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5515  putative lipoprotein  38.12 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63340  putative lipoprotein  37.5 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0331775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4588  lipoprotein  38.65 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0554174 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0738  hypothetical protein  37.5 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1595  hypothetical protein  29.19 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515991  normal  0.107651 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0469  hypothetical protein  26.42 
 
 		 174 aa  51.2  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1478  hypothetical protein  30.67 
 
 		 189 aa  48.9  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.840474  normal  0.345122 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1135  hypothetical protein  26.44 
 
 		 185 aa  46.2  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.616749  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0406  putative lipoprotein  29.61 
 
 		 178 aa  46.2  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1843  conserved hypothetical protein, secreted  25.32 
 
 		 176 aa  45.1  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.547906  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1340  hypothetical protein  25.12 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.000123504 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2469  hypothetical protein  25.37 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2866  hypothetical protein  29.41 
 
 		 175 aa  43.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0893  hypothetical protein  30.91 
 
 		 179 aa  42.4  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000267629  normal  0.854423 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3343  hypothetical protein  23.23 
 
 		 186 aa  41.6  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>