31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0640 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0640  putative lipoprotein  100 
 
 		 212 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.508137  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0739  lipoprotein, putative  89.15 
 
 		 212 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0634  putative lipoprotein  62.26 
 
 		 203 aa  209  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4587  lipoprotein  61 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0622  hypothetical protein  61.24 
 
 		 211 aa  174  8e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0577  hypothetical protein  60.77 
 
 		 231 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.603488 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0616  hypothetical protein  60.77 
 
 		 211 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0739  hypothetical protein  52.13 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63320  hypothetical protein  50.79 
 
 		 206 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5514  hypothetical protein  50.79 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07250  lipoprotein  44.74 
 
 		 201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0738  lipoprotein, putative  32.56 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0635  putative lipoprotein  34.76 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07240  hypothetical protein  31.28 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0639  putative lipoprotein  29.63 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0346116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0615  hypothetical protein  31.28 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5515  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0576  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4588  lipoprotein  32.73 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0554174 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63340  putative lipoprotein  32.73 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0331775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0406  putative lipoprotein  32.69 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0621  lipoprotein  32.73 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304887 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0738  hypothetical protein  34.73 
 
 		 184 aa  62  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2845  hypothetical protein  24.58 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0469  hypothetical protein  22.41 
 
 		 174 aa  50.8  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1006  hypothetical protein  26.67 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.230842 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1528  hypothetical protein  32.35 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2469  hypothetical protein  25 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1340  hypothetical protein  21.23 
 
 		 189 aa  42.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.000123504 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1843  conserved hypothetical protein, secreted  22.64 
 
 		 176 aa  42.7  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.547906  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1478  hypothetical protein  27.88 
 
 		 189 aa  41.2  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.840474  normal  0.345122 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>