44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0622 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0622  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  417  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0577  hypothetical protein  95.26 
 
 		 231 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.603488 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0616  hypothetical protein  95.73 
 
 		 211 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4587  lipoprotein  89.1 
 
 		 211 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0634  putative lipoprotein  61.95 
 
 		 203 aa  192  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0739  lipoprotein, putative  57.87 
 
 		 212 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0640  putative lipoprotein  60.58 
 
 		 212 aa  188  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.508137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0739  hypothetical protein  50.73 
 
 		 193 aa  149  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63320  hypothetical protein  50 
 
 		 206 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5514  hypothetical protein  49.51 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07250  lipoprotein  45.36 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07240  hypothetical protein  33.53 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0639  putative lipoprotein  30.59 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0346116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0738  hypothetical protein  36.69 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0615  hypothetical protein  30.59 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5515  putative lipoprotein  36.09 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63340  putative lipoprotein  35.39 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0331775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0635  putative lipoprotein  32.43 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2469  hypothetical protein  29.7 
 
 		 186 aa  72  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0738  lipoprotein, putative  32.79 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2845  hypothetical protein  26.26 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4588  lipoprotein  32.04 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0554174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0576  putative lipoprotein  30.24 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0621  lipoprotein  29.76 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304887 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1340  hypothetical protein  25.42 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.000123504 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1135  hypothetical protein  28.09 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.616749  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1240  hypothetical protein  23.91 
 
 		 186 aa  62  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2676  hypothetical protein  24.29 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000868105  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3343  hypothetical protein  24.24 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1202  hypothetical protein  23.64 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0005069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1273  hypothetical protein  23.64 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000675373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1203  hypothetical protein  23.64 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.063894  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0469  hypothetical protein  23.46 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2866  hypothetical protein  25.96 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1347  hypothetical protein  24.24 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000908641  hitchhiker  0.0000000000414512 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3174  hypothetical protein  24.24 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00025899  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3016  hypothetical protein  24.24 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842441  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1147  hypothetical protein  23.86 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00658881  normal  0.0364761 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3031  hypothetical protein  24.24 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2678  hypothetical protein  25.45 
 
 		 186 aa  54.7  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.019239  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6525  hypothetical protein  26.9 
 
 		 189 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0406  putative lipoprotein  26.32 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1478  hypothetical protein  28.15 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.840474  normal  0.345122 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1595  hypothetical protein  26.7 
 
 		 194 aa  41.6  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515991  normal  0.107651 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>