57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2866 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2866  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  361  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000348  hypothetical protein  34.12 
 
 
172 aa  93.6  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1735  hypothetical protein  31.58 
 
 
175 aa  90.1  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.428969  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2845  hypothetical protein  27.72 
 
 
185 aa  90.5  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06158  hypothetical protein  32.94 
 
 
172 aa  90.1  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3343  hypothetical protein  27.62 
 
 
186 aa  87.8  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1240  hypothetical protein  27.62 
 
 
186 aa  87  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3174  hypothetical protein  26.52 
 
 
186 aa  85.1  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00025899  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3016  hypothetical protein  26.52 
 
 
186 aa  85.1  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842441  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1347  hypothetical protein  26.52 
 
 
186 aa  85.1  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000908641  hitchhiker  0.0000000000414512 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1340  hypothetical protein  28.33 
 
 
189 aa  84.7  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.000123504 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3031  hypothetical protein  26.52 
 
 
186 aa  84.3  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2676  hypothetical protein  27.47 
 
 
185 aa  84  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000868105  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1203  hypothetical protein  25.41 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.063894  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1273  hypothetical protein  25.41 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000675373  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1202  hypothetical protein  25.41 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0005069  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2678  hypothetical protein  25.41 
 
 
186 aa  82  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.019239  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2469  hypothetical protein  26.67 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1135  hypothetical protein  25.13 
 
 
185 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.616749  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1147  hypothetical protein  27.47 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00658881  normal  0.0364761 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1843  conserved hypothetical protein, secreted  30.9 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.547906  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1595  hypothetical protein  28.18 
 
 
194 aa  67.8  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515991  normal  0.107651 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0639  putative lipoprotein  23.66 
 
 
188 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0346116  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0469  hypothetical protein  24.86 
 
 
174 aa  64.3  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1947  putative lipoprotein  24.86 
 
 
188 aa  61.6  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00779715 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05585  hypothetical protein  25.86 
 
 
173 aa  59.3  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1006  hypothetical protein  25.27 
 
 
196 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.230842 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1478  hypothetical protein  30.08 
 
 
189 aa  58.9  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.840474  normal  0.345122 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4587  lipoprotein  29.52 
 
 
211 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00590  putative lipoprotein  28.92 
 
 
183 aa  57.8  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.966617  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07240  hypothetical protein  26.67 
 
 
181 aa  57  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6525  hypothetical protein  21.97 
 
 
189 aa  54.3  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1444  putative lipoprotein  23.84 
 
 
191 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0676228  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0615  hypothetical protein  25.65 
 
 
189 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157882  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1528  hypothetical protein  26.09 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0738  hypothetical protein  25.95 
 
 
184 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0616  hypothetical protein  25.96 
 
 
211 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145127  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0577  hypothetical protein  25.96 
 
 
231 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.603488 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1660  hypothetical protein  24.57 
 
 
195 aa  51.2  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.715972  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0622  hypothetical protein  25.48 
 
 
211 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0113849 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0738  lipoprotein, putative  20.83 
 
 
187 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0634  putative lipoprotein  30.13 
 
 
203 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1146  hypothetical protein  22.58 
 
 
192 aa  47.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1605  hypothetical protein  22.95 
 
 
192 aa  46.2  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4588  lipoprotein  26.01 
 
 
189 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0554174 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0621  lipoprotein  25.99 
 
 
189 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0304887 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5514  hypothetical protein  31.17 
 
 
206 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0406  putative lipoprotein  25.97 
 
 
178 aa  45.4  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0576  putative lipoprotein  25.99 
 
 
189 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0739  lipoprotein, putative  24.84 
 
 
212 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1107  hypothetical protein  22.7 
 
 
184 aa  45.1  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138586 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63320  hypothetical protein  30.52 
 
 
206 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.382346  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3639  lipoprotein  23.63 
 
 
191 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.171802 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1907  hypothetical protein  24.71 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905779  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0640  putative lipoprotein  24.22 
 
 
212 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.508137  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0498  putative lipoprotein  24.59 
 
 
187 aa  42.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0635  putative lipoprotein  25.3 
 
 
185 aa  42.4  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>