67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1006 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1006  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  408  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.230842 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1478  hypothetical protein  58.43 
 
 
189 aa  216  2e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.840474  normal  0.345122 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1660  hypothetical protein  44.89 
 
 
195 aa  154  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.715972  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1528  hypothetical protein  34.57 
 
 
201 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2676  hypothetical protein  31.41 
 
 
185 aa  95.9  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000868105  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1340  hypothetical protein  29.02 
 
 
189 aa  93.2  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.000123504 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2845  hypothetical protein  28.57 
 
 
185 aa  91.7  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1843  conserved hypothetical protein, secreted  33.16 
 
 
176 aa  87  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.547906  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1240  hypothetical protein  27.89 
 
 
186 aa  86.7  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1135  hypothetical protein  29.03 
 
 
185 aa  85.1  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.616749  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3174  hypothetical protein  29.47 
 
 
186 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00025899  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1347  hypothetical protein  29.47 
 
 
186 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000908641  hitchhiker  0.0000000000414512 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3016  hypothetical protein  29.47 
 
 
186 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842441  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2678  hypothetical protein  30.27 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.019239  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3031  hypothetical protein  29.47 
 
 
186 aa  82  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07240  hypothetical protein  31.61 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1202  hypothetical protein  28.89 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0005069  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1273  hypothetical protein  28.89 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000675373  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1203  hypothetical protein  28.89 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.063894  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6525  hypothetical protein  27.03 
 
 
189 aa  80.9  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00590  putative lipoprotein  29.89 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.966617  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3343  hypothetical protein  28.8 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1947  putative lipoprotein  29.17 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00779715 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1605  hypothetical protein  26.7 
 
 
192 aa  77.8  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0639  putative lipoprotein  26.46 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0346116  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0738  lipoprotein, putative  27.81 
 
 
187 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2469  hypothetical protein  26.06 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1146  hypothetical protein  28.5 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1147  hypothetical protein  28.32 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00658881  normal  0.0364761 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0615  hypothetical protein  26.6 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157882  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1101  hypothetical protein  28.11 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  normal  0.0488625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1068  hypothetical protein  28.11 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000510345  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0469  hypothetical protein  26.67 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1595  hypothetical protein  26.98 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515991  normal  0.107651 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0999  hypothetical protein  28.11 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000998217  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1907  hypothetical protein  28.07 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905779  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06158  hypothetical protein  25.63 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3290  hypothetical protein  26.49 
 
 
178 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000451719  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0621  lipoprotein  26.44 
 
 
189 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0304887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0576  putative lipoprotein  26.44 
 
 
189 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5515  putative lipoprotein  28.16 
 
 
187 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000348  hypothetical protein  26.2 
 
 
172 aa  61.6  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3161  hypothetical protein  25.14 
 
 
191 aa  61.2  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0738  hypothetical protein  25.73 
 
 
184 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63340  putative lipoprotein  27.01 
 
 
187 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0331775  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4076  hypothetical protein  26.59 
 
 
186 aa  58.9  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0406  putative lipoprotein  24.71 
 
 
178 aa  57.8  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1007  hypothetical protein  26.22 
 
 
178 aa  56.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613639  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4588  lipoprotein  25.43 
 
 
189 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0554174 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3234  putative lipoprotein  25.26 
 
 
192 aa  54.3  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.104755  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2866  hypothetical protein  25 
 
 
175 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3009  hypothetical protein  26.46 
 
 
178 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  normal  0.0687233 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1444  putative lipoprotein  28.48 
 
 
191 aa  52.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0676228  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3187  hypothetical protein  28.02 
 
 
178 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00707615  normal  0.59429 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1735  hypothetical protein  25.54 
 
 
175 aa  49.3  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.428969  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1027  hypothetical protein  28.95 
 
 
179 aa  48.9  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000130627  normal  0.110707 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3597  hypothetical protein  26.92 
 
 
178 aa  48.9  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0893  hypothetical protein  23.04 
 
 
179 aa  48.1  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000267629  normal  0.854423 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3090  hypothetical protein  24.47 
 
 
175 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00239332  normal  0.428293 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6323  putative lipoprotein  26.09 
 
 
189 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0635  putative lipoprotein  23.21 
 
 
185 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0978  hypothetical protein  26.9 
 
 
196 aa  46.2  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133342  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3472  hypothetical protein  24.24 
 
 
177 aa  45.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000238843  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1107  hypothetical protein  18.09 
 
 
184 aa  45.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138586 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0934  hypothetical protein  23.44 
 
 
192 aa  44.7  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3639  lipoprotein  20 
 
 
191 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.171802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0498  putative lipoprotein  21.94 
 
 
187 aa  41.2  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>