41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3234 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3234  putative lipoprotein  100 
 
 		 192 aa  398  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.104755  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0469  hypothetical protein  27.66 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2845  hypothetical protein  29.44 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3031  hypothetical protein  32.02 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6525  hypothetical protein  26.2 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1347  hypothetical protein  31.46 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000908641  hitchhiker  0.0000000000414512 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3174  hypothetical protein  31.46 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00025899  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3016  hypothetical protein  31.46 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842441  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1273  hypothetical protein  32.09 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000675373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1202  hypothetical protein  32.09 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0005069  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3343  hypothetical protein  31.11 
 
 		 186 aa  67  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2676  hypothetical protein  27.37 
 
 		 185 aa  67  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000868105  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1203  hypothetical protein  31.55 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.063894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1340  hypothetical protein  29.89 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.000123504 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2678  hypothetical protein  32.39 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.019239  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1240  hypothetical protein  28.19 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1135  hypothetical protein  30.11 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.616749  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1605  hypothetical protein  29.84 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1006  hypothetical protein  28.14 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.230842 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0639  putative lipoprotein  24.1 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0346116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2469  hypothetical protein  30.38 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07240  hypothetical protein  24.86 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1595  hypothetical protein  25.27 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515991  normal  0.107651 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1907  hypothetical protein  28.41 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905779  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3161  hypothetical protein  20.96 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4152  putative lipoprotein  25.48 
 
 		 183 aa  53.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1147  hypothetical protein  26.49 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00658881  normal  0.0364761 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1843  conserved hypothetical protein, secreted  22.92 
 
 		 176 aa  51.2  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.547906  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1478  hypothetical protein  24.62 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.840474  normal  0.345122 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00940  hypothetical protein  26.84 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.292932  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1947  putative lipoprotein  23.53 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779715 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6323  putative lipoprotein  29.91 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0738  lipoprotein, putative  22.73 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00590  putative lipoprotein  24.35 
 
 		 183 aa  48.9  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.966617  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1101  hypothetical protein  26.83 
 
 		 178 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  normal  0.0488625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1068  hypothetical protein  26.83 
 
 		 178 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000510345  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3290  hypothetical protein  24.69 
 
 		 178 aa  45.1  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000451719  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0999  hypothetical protein  25.31 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000998217  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4076  hypothetical protein  30.22 
 
 		 186 aa  42  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3187  hypothetical protein  26.98 
 
 		 178 aa  41.6  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00707615  normal  0.59429 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1146  hypothetical protein  24.21 
 
 		 192 aa  41.2  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>