41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4152 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4152  putative lipoprotein  100 
 
 		 183 aa  374  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3290  hypothetical protein  33.92 
 
 		 178 aa  92.4  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000451719  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0999  hypothetical protein  33.92 
 
 		 178 aa  92  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000998217  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1101  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  normal  0.0488625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1068  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000510345  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0978  hypothetical protein  31.55 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3187  hypothetical protein  30.94 
 
 		 178 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00707615  normal  0.59429 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3009  hypothetical protein  30.94 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  normal  0.0687233 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3090  hypothetical protein  31.49 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00239332  normal  0.428293 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3597  hypothetical protein  29.44 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0875  hypothetical protein  36.31 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000548389  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2803  hypothetical protein  31.14 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.316903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1240  hypothetical protein  29.1 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1027  hypothetical protein  36.16 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000130627  normal  0.110707 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1843  conserved hypothetical protein, secreted  29.19 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.547906  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1007  hypothetical protein  31.36 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613639  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0934  hypothetical protein  32.74 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0893  hypothetical protein  33.9 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000267629  normal  0.854423 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00940  hypothetical protein  26.82 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.292932  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2469  hypothetical protein  26.74 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1340  hypothetical protein  26.98 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.000123504 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3343  hypothetical protein  28.34 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1135  hypothetical protein  27.66 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.616749  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1347  hypothetical protein  25.41 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000908641  hitchhiker  0.0000000000414512 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3016  hypothetical protein  25.41 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842441  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3174  hypothetical protein  25.41 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00025899  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1203  hypothetical protein  28.04 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.063894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2845  hypothetical protein  25.13 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3031  hypothetical protein  25.41 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1273  hypothetical protein  27.51 
 
 		 186 aa  51.6  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000675373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1202  hypothetical protein  27.51 
 
 		 186 aa  51.6  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0005069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2676  hypothetical protein  27.23 
 
 		 185 aa  52  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000868105  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2678  hypothetical protein  24.06 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.019239  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0639  putative lipoprotein  21.35 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0346116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1147  hypothetical protein  24.6 
 
 		 187 aa  47.8  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00658881  normal  0.0364761 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0469  hypothetical protein  25 
 
 		 174 aa  44.7  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1605  hypothetical protein  25.14 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06158  hypothetical protein  24.46 
 
 		 172 aa  42.4  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3234  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 192 aa  42  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.104755  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1595  hypothetical protein  23.46 
 
 		 194 aa  42  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515991  normal  0.107651 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6525  hypothetical protein  24.49 
 
 		 189 aa  41.6  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>