24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00940 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00940  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  404  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.292932  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2803  hypothetical protein  31.52 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.316903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1101  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  normal  0.0488625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1068  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000510345  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0999  hypothetical protein  33.14 
 
 		 178 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000998217  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3290  hypothetical protein  32.54 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000451719  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3187  hypothetical protein  32.95 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00707615  normal  0.59429 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3009  hypothetical protein  32.37 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  normal  0.0687233 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3597  hypothetical protein  30.23 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3090  hypothetical protein  31.79 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00239332  normal  0.428293 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4152  putative lipoprotein  26.82 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0978  hypothetical protein  27.33 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1240  hypothetical protein  27.27 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1340  hypothetical protein  26.32 
 
 		 189 aa  52.4  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.000123504 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0934  hypothetical protein  29.83 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1135  hypothetical protein  26.37 
 
 		 185 aa  48.9  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.616749  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1027  hypothetical protein  30.41 
 
 		 179 aa  48.5  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000130627  normal  0.110707 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1007  hypothetical protein  32.52 
 
 		 178 aa  45.1  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613639  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0639  putative lipoprotein  24.74 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0346116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2845  hypothetical protein  25.41 
 
 		 185 aa  41.6  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3343  hypothetical protein  24.73 
 
 		 186 aa  41.6  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3174  hypothetical protein  26.67 
 
 		 186 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00025899  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3016  hypothetical protein  26.67 
 
 		 186 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842441  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1347  hypothetical protein  26.67 
 
 		 186 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000908641  hitchhiker  0.0000000000414512 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>