34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0739 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0739  lipoprotein, putative  100 
 
 		 212 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0640  putative lipoprotein  89.15 
 
 		 212 aa  325  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.508137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0634  putative lipoprotein  64.18 
 
 		 203 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4587  lipoprotein  59.5 
 
 		 211 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0577  hypothetical protein  58.53 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.603488 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0616  hypothetical protein  58.53 
 
 		 211 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0622  hypothetical protein  58.99 
 
 		 211 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113849 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0739  hypothetical protein  52.13 
 
 		 193 aa  159  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63320  hypothetical protein  45.05 
 
 		 206 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07250  lipoprotein  46.32 
 
 		 201 aa  135  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5514  hypothetical protein  49.21 
 
 		 206 aa  131  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07240  hypothetical protein  32.78 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0635  putative lipoprotein  34.15 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0639  putative lipoprotein  28.11 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0346116  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0738  lipoprotein, putative  30.81 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5515  putative lipoprotein  30.73 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4588  lipoprotein  30.3 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0554174 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0738  hypothetical protein  33.53 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63340  putative lipoprotein  30.17 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0331775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0615  hypothetical protein  27.83 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2845  hypothetical protein  25 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0406  putative lipoprotein  30.13 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0576  putative lipoprotein  30.3 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0621  lipoprotein  29.7 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304887 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0469  hypothetical protein  23.43 
 
 		 174 aa  54.7  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1006  hypothetical protein  27.27 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.230842 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1528  hypothetical protein  31.37 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1340  hypothetical protein  22.27 
 
 		 189 aa  45.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.000123504 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2469  hypothetical protein  26.83 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1135  hypothetical protein  23.56 
 
 		 185 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.616749  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6525  hypothetical protein  27.01 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2866  hypothetical protein  26.88 
 
 		 175 aa  42.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1478  hypothetical protein  27.88 
 
 		 189 aa  42.7  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.840474  normal  0.345122 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2676  hypothetical protein  23.76 
 
 		 185 aa  41.2  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000868105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>