21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4738 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4738  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  384  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1135  hypothetical protein  26.23 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.616749  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1240  hypothetical protein  24.6 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3343  hypothetical protein  28.19 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1340  hypothetical protein  25.95 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.000123504 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2469  hypothetical protein  26.63 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2845  hypothetical protein  24.34 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1347  hypothetical protein  27.13 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000908641  hitchhiker  0.0000000000414512 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3016  hypothetical protein  27.13 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842441  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3174  hypothetical protein  27.13 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00025899  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3031  hypothetical protein  27.13 
 
 		 186 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1203  hypothetical protein  25.53 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.063894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1273  hypothetical protein  25.53 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000675373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1202  hypothetical protein  25.53 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0005069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2678  hypothetical protein  24.86 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.019239  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4076  hypothetical protein  22.58 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2676  hypothetical protein  22.58 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000868105  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00590  putative lipoprotein  25 
 
 		 183 aa  45.1  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.966617  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1478  hypothetical protein  23.46 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.840474  normal  0.345122 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1605  hypothetical protein  26.29 
 
 		 192 aa  42.4  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1735  hypothetical protein  23.08 
 
 		 175 aa  41.6  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.428969  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>