More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1405 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1405  peptidase C26  100 
 
 
209 aa  434  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0772  peptidase C26  35.58 
 
 
212 aa  135  4e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29431  hypothetical protein  34.42 
 
 
207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0661  peptidase C26  35.5 
 
 
212 aa  128  8.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.576889 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5513  glutamine amidotransferase class-I  36.11 
 
 
198 aa  122  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0727  hypothetical protein  39.32 
 
 
200 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0015  peptidase C26  32.38 
 
 
207 aa  115  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0676667 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0315  conserved hypothetical protein, putative glutamine amidotransferase  33.84 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3393  peptidase C26  33.94 
 
 
213 aa  109  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12660  predicted glutamine amidotransferase  32.14 
 
 
218 aa  102  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1416  class I glutamine amidotransferase, putative  31.4 
 
 
200 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0610081  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7109  hypothetical protein  31.68 
 
 
204 aa  97.1  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1631  glutamine amidotransferase class-I  35.1 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1750  hypothetical protein  30.05 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  31.94 
 
 
235 aa  81.3  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1775  glutamine amidotransferase  27.63 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113696 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  33.33 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1237  peptidase C26  32.97 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  32.12 
 
 
259 aa  77  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  31.05 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0455  glutamine amidotransferase, class I  31.48 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1617  glutamine amidotransferase, class I  33.33 
 
 
444 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2371  peptidase C26  33.74 
 
 
405 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167921  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1164  peptidase C26  29.35 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.399023  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1197  peptidase C26  29.35 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0734619  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3194  peptidase C26  29.35 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0388042 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1106  peptidase C26  29.35 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00657887  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2910  peptidase C26  31.48 
 
 
442 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.486072  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3017  glutamine amidotransferase, class I  31.48 
 
 
442 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4137  peptidase C26  31.48 
 
 
251 aa  72  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0973  glutamine amidotransferase, class I  31.48 
 
 
444 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0173  peptidase C26  31.48 
 
 
444 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2602  peptidase C26  31.48 
 
 
444 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2970  peptidase C26  31.48 
 
 
442 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1092  peptidase C26  29.89 
 
 
253 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337501  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0545  peptidase C26  33.13 
 
 
396 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0983  peptidase C26  33.13 
 
 
396 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290196  normal  0.093467 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1024  peptidase C26  33.13 
 
 
396 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3099  peptidase C26  29.35 
 
 
253 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.015015  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  27 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5047  peptidase C26  30.05 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  31.52 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2920  peptidase C26  28.8 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129807  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0888  peptidase C26  33.74 
 
 
427 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1099  peptidase C26  28.49 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0900  peptidase C26  33.74 
 
 
399 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.332784  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1740  peptidase C26  28.96 
 
 
256 aa  68.6  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000655544 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  27.12 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1643  glutamine amidotransferase, class I  28.91 
 
 
229 aa  67  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1267  glutamine amidotransferase  28.8 
 
 
253 aa  67  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3002  peptidase C26  28.26 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00604755  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  27.92 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  31.84 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  27.31 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  28.08 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  27.81 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0717  peptidase C26  31.48 
 
 
479 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.777258  normal  0.355316 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0954  putative amidotransferase  30.25 
 
 
251 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.716357 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  27.78 
 
 
264 aa  64.7  0.0000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3195  peptidase C26  29.09 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  27.95 
 
 
238 aa  64.3  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  27.07 
 
 
242 aa  64.3  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2645  glutamine amidotransferase  27.27 
 
 
254 aa  64.3  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  30 
 
 
241 aa  63.5  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  32.16 
 
 
238 aa  63.9  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3033  peptidase C26  29.63 
 
 
493 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.998523  decreased coverage  0.0021965 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3012  peptidase C26  29.35 
 
 
254 aa  63.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2813  peptidase C26  27.17 
 
 
269 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2671  peptidase C26  32.72 
 
 
229 aa  63.5  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0625878 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  29.59 
 
 
279 aa  63.2  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3033  peptidase C26  28.92 
 
 
254 aa  63.2  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.008786  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  28.4 
 
 
247 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3991  hypothetical protein  29.63 
 
 
229 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0400316  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  29.51 
 
 
233 aa  62  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4227  peptidase C26  42.65 
 
 
260 aa  62  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1848  peptidase C26  27.65 
 
 
251 aa  62  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  33.1 
 
 
254 aa  61.6  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1059  peptidase C26  28.26 
 
 
253 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22875  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  27.46 
 
 
272 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1429  glutamine amidotransferase (class I), putative  31.95 
 
 
231 aa  60.8  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0794  hypothetical protein  28.96 
 
 
267 aa  60.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  26.63 
 
 
241 aa  60.5  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1141  putative transferase  26.38 
 
 
266 aa  60.5  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0928367 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0944  peptidase C26  29.57 
 
 
253 aa  59.7  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1945  glutamine amidotransferase, class I  28.8 
 
 
313 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0746135  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  27.68 
 
 
264 aa  60.1  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2887  peptidase C26  32.77 
 
 
221 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.550139  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  31.32 
 
 
250 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  28.57 
 
 
244 aa  59.3  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  30 
 
 
230 aa  59.3  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  29.31 
 
 
255 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  29.01 
 
 
251 aa  58.9  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  27.33 
 
 
231 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3677  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  28.26 
 
 
259 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.272698 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0655  glutamine amidotransferase, class I  32.43 
 
 
263 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1549  peptidase C26  26.83 
 
 
258 aa  58.9  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2655  glutamine amidotransferase, class I  32.43 
 
 
263 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  25.44 
 
 
238 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1670  glutamine amidotransferase, class I  32.43 
 
 
264 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.661584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2356  glutamine amidotransferase, class I  32.43 
 
 
264 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>