More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3393 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3393  peptidase C26  100 
 
 
213 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0015  peptidase C26  38.94 
 
 
207 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0676667 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0661  peptidase C26  33.16 
 
 
212 aa  131  6e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.576889 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1405  peptidase C26  33.94 
 
 
209 aa  109  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7109  hypothetical protein  33.8 
 
 
204 aa  98.2  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0727  hypothetical protein  36.04 
 
 
200 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29431  hypothetical protein  35.75 
 
 
207 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5513  glutamine amidotransferase class-I  36.36 
 
 
198 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0772  peptidase C26  33.18 
 
 
212 aa  87  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0315  conserved hypothetical protein, putative glutamine amidotransferase  31.5 
 
 
199 aa  85.9  5e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1631  glutamine amidotransferase class-I  31.76 
 
 
194 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12660  predicted glutamine amidotransferase  27.94 
 
 
218 aa  77  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  35.84 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  30.94 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  33 
 
 
250 aa  67  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  30.85 
 
 
230 aa  67  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  33 
 
 
250 aa  67  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  26.74 
 
 
238 aa  66.2  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  29.15 
 
 
241 aa  65.1  0.0000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2669  peptidase C26  29.9 
 
 
288 aa  64.7  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0275908  normal  0.209518 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0954  putative amidotransferase  33.33 
 
 
251 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.716357 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  30.48 
 
 
602 aa  63.2  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1416  class I glutamine amidotransferase, putative  27 
 
 
200 aa  62.4  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0610081  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3033  peptidase C26  33.33 
 
 
493 aa  62  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.998523  decreased coverage  0.0021965 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0455  glutamine amidotransferase, class I  31.67 
 
 
356 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1617  glutamine amidotransferase, class I  31.67 
 
 
444 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2970  peptidase C26  31.67 
 
 
442 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2910  peptidase C26  31.67 
 
 
442 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.486072  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  30.99 
 
 
238 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0173  peptidase C26  31.67 
 
 
444 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3017  glutamine amidotransferase, class I  31.67 
 
 
442 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  28.29 
 
 
242 aa  60.5  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2602  peptidase C26  31.67 
 
 
444 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0973  glutamine amidotransferase, class I  31.67 
 
 
444 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4678  hypothetical protein  29.76 
 
 
255 aa  60.1  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1643  glutamine amidotransferase, class I  27.91 
 
 
229 aa  58.5  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2275  anthranilate synthase  35.24 
 
 
736 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130405 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2371  peptidase C26  31.67 
 
 
405 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167921  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1887  peptidase C26  28.78 
 
 
281 aa  58.2  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192004  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0717  peptidase C26  31.11 
 
 
479 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.777258  normal  0.355316 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0244  glutamine amidotransferase  28.78 
 
 
281 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.682625  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  26.73 
 
 
241 aa  57.4  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  29.9 
 
 
264 aa  57.4  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4137  peptidase C26  30.56 
 
 
251 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1429  glutamine amidotransferase (class I), putative  24.58 
 
 
231 aa  57  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  32.92 
 
 
235 aa  57  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1141  putative transferase  31.32 
 
 
266 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0928367 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  27.01 
 
 
238 aa  57.4  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1386  anthranilate synthase  31.69 
 
 
726 aa  56.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0900  peptidase C26  30.56 
 
 
399 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.332784  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0545  peptidase C26  30.56 
 
 
396 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  33.54 
 
 
254 aa  56.2  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0888  peptidase C26  30.56 
 
 
427 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1024  peptidase C26  30.56 
 
 
396 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0983  peptidase C26  30.56 
 
 
396 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290196  normal  0.093467 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  30.64 
 
 
312 aa  55.8  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1536  peptidase C26  28.02 
 
 
276 aa  55.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  29.29 
 
 
233 aa  55.8  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0710  peptidase C26  27.88 
 
 
263 aa  55.5  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.391948  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  32.75 
 
 
252 aa  55.1  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0570  peptidase C26  29.56 
 
 
240 aa  55.5  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0083889  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3546  anthranilate synthase  36.84 
 
 
728 aa  55.1  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1559  anthranilate synthase component II  31.11 
 
 
193 aa  54.7  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0171516  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3960  peptidase C26  29.7 
 
 
313 aa  54.7  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0591478 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  27.59 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  28.57 
 
 
244 aa  54.7  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  29.03 
 
 
240 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1549  peptidase C26  33.75 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3790  hypothetical protein  31.54 
 
 
254 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  29.19 
 
 
264 aa  53.9  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2450  peptidase C26  31.58 
 
 
409 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1367  peptidase C26  29.83 
 
 
239 aa  53.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  31.48 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  31.74 
 
 
262 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  28.64 
 
 
256 aa  53.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  30.06 
 
 
238 aa  53.1  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1750  hypothetical protein  30.22 
 
 
179 aa  52.8  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4064  peptidase C26  30.96 
 
 
256 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3226  peptidase C26  30 
 
 
285 aa  52.8  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  33.54 
 
 
233 aa  52.8  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  24.34 
 
 
238 aa  52.8  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  30 
 
 
250 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2671  peptidase C26  28.8 
 
 
229 aa  52.8  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0625878 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2112  glutamine amidotransferase class-I:peptidase C26  33.96 
 
 
260 aa  52.4  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0486861  normal  0.283308 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27778  predicted protein  28.31 
 
 
547 aa  52.4  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246017  normal  0.194764 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4023  peptidase C26  32.26 
 
 
256 aa  52.4  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0794  hypothetical protein  28.44 
 
 
267 aa  52.4  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0121  peptidase C26  31.41 
 
 
407 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  28.77 
 
 
248 aa  52  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1229  peptidase C26  26.91 
 
 
259 aa  52  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.121618 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0364  anthranilate synthase  35.14 
 
 
734 aa  52  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  30.09 
 
 
240 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  29.1 
 
 
267 aa  52  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  28.34 
 
 
245 aa  51.6  0.000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  31.63 
 
 
272 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  30.09 
 
 
240 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0133  GMP synthase subunit A  27.92 
 
 
189 aa  51.6  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361551  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  30.09 
 
 
251 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1160  peptidase C26  30.57 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0121  peptidase C26  29.73 
 
 
255 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.186192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>