More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5513 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5513  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 		 198 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29431  hypothetical protein  56.22 
 
 		 207 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0772  peptidase C26  49.22 
 
 		 212 aa  167  9e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0727  hypothetical protein  38.58 
 
 		 200 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1405  peptidase C26  36.11 
 
 		 209 aa  122  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7109  hypothetical protein  38.27 
 
 		 204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0315  conserved hypothetical protein, putative glutamine amidotransferase  32.61 
 
 		 199 aa  115  3e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0015  peptidase C26  37.37 
 
 		 207 aa  95.5  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0676667 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0661  peptidase C26  28.23 
 
 		 212 aa  95.5  5e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.576889 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3393  peptidase C26  36.36 
 
 		 213 aa  94.4  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1631  glutamine amidotransferase class-I  32.52 
 
 		 194 aa  92  4e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1416  class I glutamine amidotransferase, putative  26.63 
 
 		 200 aa  91.7  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0610081  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1750  hypothetical protein  28.48 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12660  predicted glutamine amidotransferase  32.64 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0589  anthranilate synthase component II  32.17 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111848  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0330  anthranilate synthase component II  32.87 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1654  anthranilate synthase component II  31.47 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.643842  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0247  anthranilate synthase component II  31.47 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0869  GMP synthase subunit A  30.26 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143243  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1118  anthranilate synthase component II  31.29 
 
 		 196 aa  67  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0626  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), C-terminal domain protein  34.48 
 
 		 520 aa  67  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  28.72 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0702  GMP synthase  31.13 
 
 		 520 aa  64.3  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1211  anthranilate synthase component II  33.8 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.903358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0919  GMP synthase subunit A  36.11 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.956828 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  33.53 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  30.38 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1964  peptidase C26  32.19 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3627  anthranilate synthase component II  32.65 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0768  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  34.29 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.474408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3925  peptidase C26  34.44 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.792522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4455  anthranilate synthase component II  32.39 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1160  peptidase C26  33.55 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  33.82 
 
 		 522 aa  60.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  27.41 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  32.35 
 
 		 515 aa  60.1  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  28.57 
 
 		 525 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4670  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  32.68 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0133  GMP synthase subunit A  28.29 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361551  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5133  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  32.68 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0868707 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  34.39 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1848  peptidase C26  33.75 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0368  anthranilate synthase component II  30.99 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0583  anthranilate synthase component II  30.99 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  36.42 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1570  anthranilate synthase  35.82 
 
 		 731 aa  58.5  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1688  anthranilate synthase  32.54 
 
 		 738 aa  58.9  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.231045 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2295  anthranilate synthase  32.84 
 
 		 729 aa  58.9  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.23591 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  28.66 
 
 		 510 aa  58.9  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  31.44 
 
 		 602 aa  58.5  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0794  hypothetical protein  32.03 
 
 		 267 aa  58.5  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1516  anthranilate synthase  35.82 
 
 		 731 aa  58.5  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0166  GMP synthase subunit A  31.5 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0358  anthranilate synthase component II  30.99 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4443  para-aminobenzoate synthase, subunit I  32.17 
 
 		 721 aa  58.2  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3617  aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase subunit  37.08 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.372082  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1597  anthranilate synthase  34.33 
 
 		 731 aa  58.2  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2861  anthranilate synthase component II  32.61 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2184  GMP synthase, large subunit  34.69 
 
 		 507 aa  58.2  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.255738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  31.41 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2671  peptidase C26  30.72 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0625878 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  34.67 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0655  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  32.12 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197723 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  30.13 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  28.95 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0374  para-aminobenzoate synthase, glutamine amidotransferase, component II  30.88 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  30.14 
 
 		 732 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00431194  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0220  GMP synthase  27.82 
 
 		 522 aa  57  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1190  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  34.33 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00563763  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5210  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  31.13 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2279  peptidase C26  34.75 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0249  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  32.14 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2620  glutamine amidotransferase class-I  36.56 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.774772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0062  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  31.94 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1775  glutamine amidotransferase  24.67 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113696 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1553  anthranilate synthase component II  32.79 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000467195  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1228  GMP synthase subunit A  26.97 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3078  anthranilate synthase  29.68 
 
 		 729 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3631  GMP synthase  28.47 
 
 		 527 aa  56.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6135  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  37.39 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6529  GMP synthase  28.9 
 
 		 519 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413067  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2812  anthranilate synthase  32.58 
 
 		 729 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0309756 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0598  GMP synthase  31.25 
 
 		 505 aa  56.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  32.52 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  24.82 
 
 		 514 aa  55.8  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1768  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  31.13 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  32.52 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2576  GMP synthase  30.34 
 
 		 529 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000141885 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0520  peptidase C26  36.3 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0509  peptidase C26  36.3 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  32.52 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0498  peptidase C26  36.3 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28505  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2882  anthranilate synthase component II  35.51 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.521517 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3652  anthranilate synthase component II  31.43 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3259  anthranilate synthase  30.97 
 
 		 729 aa  55.5  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3546  anthranilate synthase  35.4 
 
 		 728 aa  55.5  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  31.72 
 
 		 520 aa  55.5  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3124  anthranilate synthase component II  36.36 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.680889 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  26.34 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  30.62 
 
 		 267 aa  55.1  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>