More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7109 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7109  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29431  hypothetical protein  37.93 
 
 		 207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0727  hypothetical protein  39.9 
 
 		 200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5513  glutamine amidotransferase class-I  38.27 
 
 		 198 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0772  peptidase C26  36.5 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0661  peptidase C26  30.92 
 
 		 212 aa  104  7e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.576889 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0315  conserved hypothetical protein, putative glutamine amidotransferase  33.15 
 
 		 199 aa  101  8e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3393  peptidase C26  33.8 
 
 		 213 aa  98.2  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1405  peptidase C26  31.68 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1416  class I glutamine amidotransferase, putative  28.08 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0610081  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0015  peptidase C26  31.58 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0676667 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0794  hypothetical protein  27.11 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1631  glutamine amidotransferase class-I  32.62 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12660  predicted glutamine amidotransferase  28.21 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1750  hypothetical protein  27.89 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2614  anthranilate synthase  36.21 
 
 		 727 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  29.15 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5047  peptidase C26  30.85 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  28.8 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  30.62 
 
 		 278 aa  62  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  30.62 
 
 		 278 aa  62  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3238  anthranilate synthase  35.34 
 
 		 730 aa  62  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  28.64 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  28.64 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0520  peptidase C26  32.63 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0175  peptidase C26  29.05 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000212098 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0509  peptidase C26  32.63 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  34.27 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  28.75 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0498  peptidase C26  32.63 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  27.98 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5207  peptidase C26  27.52 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1211  anthranilate synthase component II  38.38 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.903358  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5298  peptidase C26  27.52 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.49084 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2816  peptidase C26  30.58 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  31.1 
 
 		 602 aa  58.5  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4991  anthranilate synthase  33.93 
 
 		 719 aa  58.2  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0608  peptidase C26  31.4 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.982002  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  30.48 
 
 		 253 aa  58.2  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  28.32 
 
 		 241 aa  58.2  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5346  peptidase C26  28.1 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176756 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1106  peptidase C26  33.11 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  29 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1099  peptidase C26  29.15 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3598  peptidase C26  25.12 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  29.63 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2295  anthranilate synthase  32.41 
 
 		 729 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.23591 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  31.2 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4318  anthranilate synthase  32.41 
 
 		 720 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.717639 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0768  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  36.36 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.474408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0349  peptidase C26  28.37 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232683  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0943  putative glutamine amidotransferase  32.03 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.889039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  31.62 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  31.2 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  28.4 
 
 		 259 aa  57  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  29.91 
 
 		 264 aa  57  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  28.89 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0589  anthranilate synthase component II  31.3 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111848  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3097  peptidase C26  25.6 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  27.27 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2199  anthranilate synthase  35.45 
 
 		 729 aa  56.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2854  response regulator receiver protein  40 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  27.78 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1597  anthranilate synthase  32.41 
 
 		 731 aa  56.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2179  peptidase C26  27.72 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  25.24 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2706  glutamine amidotransferase  28.04 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.078896  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6342  peptidase C26  32.73 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  31.16 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3571  peptidase C26  30.06 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3259  anthranilate synthase  33.03 
 
 		 729 aa  56.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2318  peptidase C26  25.6 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  34.59 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  26.09 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1654  anthranilate synthase component II  27.52 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.643842  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3012  peptidase C26  32.73 
 
 		 261 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2379  peptidase C26  32.73 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732768  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2993  peptidase C26  32.73 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2121  peptidase C26  29.19 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0384981  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  23.74 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4064  peptidase C26  28.63 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1740  peptidase C26  31.03 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.227165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3462  anthranilate synthase, component II  36.73 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.772396  normal  0.100457 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2584  peptidase C26  32.13 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0482191  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4678  hypothetical protein  26.09 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0455  glutamine amidotransferase, class I  33.75 
 
 		 356 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6978  peptidase C26  32.03 
 
 		 275 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1617  glutamine amidotransferase, class I  35 
 
 		 444 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3790  hypothetical protein  29.06 
 
 		 254 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2366  anthranilate synthase component II  26.78 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2987  peptidase C26  31.9 
 
 		 274 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0247  anthranilate synthase component II  29.23 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0330  anthranilate synthase component II  28.46 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2136  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  35.92 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.198158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3017  glutamine amidotransferase, class I  35 
 
 		 442 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  27.23 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2812  anthranilate synthase  31.48 
 
 		 729 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0309756 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4388  anthranilate synthase  32.38 
 
 		 720 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0144881 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4213  anthranilate synthase  33.03 
 
 		 720 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.848003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1160  peptidase C26  31.17 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>