More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4213 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1570  anthranilate synthase  53.19 
 
 
731 aa  755    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1699  anthranilate synthase  48.95 
 
 
718 aa  704    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1698  anthranilate synthase  49.02 
 
 
718 aa  705    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2614  anthranilate synthase  80.45 
 
 
727 aa  1201    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4890  anthranilate synthase  52.32 
 
 
728 aa  736    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.17479  hitchhiker  0.00747528 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1597  anthranilate synthase  53.05 
 
 
731 aa  749    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4991  anthranilate synthase  90.36 
 
 
719 aa  1347    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17238  anthranilate synthase  46.16 
 
 
958 aa  636    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.438773  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2275  anthranilate synthase  51.98 
 
 
736 aa  720    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130405 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4318  anthranilate synthase  93.3 
 
 
720 aa  1349    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.717639 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4388  anthranilate synthase  83.61 
 
 
720 aa  1256    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0144881 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2295  anthranilate synthase  50.92 
 
 
729 aa  711    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.23591 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4213  anthranilate synthase  100 
 
 
720 aa  1476    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.848003  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3238  anthranilate synthase  81.81 
 
 
730 aa  1231    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2812  anthranilate synthase  51.06 
 
 
729 aa  712    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0309756 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3078  anthranilate synthase  50.78 
 
 
729 aa  716    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2199  anthranilate synthase  51.99 
 
 
729 aa  721    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0364  anthranilate synthase  48.16 
 
 
734 aa  667    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0686  anthranilate synthase  48.59 
 
 
706 aa  635    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.562376 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2476  anthranilate synthase  50 
 
 
717 aa  654    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00498931  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1516  anthranilate synthase  53.19 
 
 
731 aa  756    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3259  anthranilate synthase  50.21 
 
 
729 aa  699    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2309  anthranilate synthase  80.73 
 
 
720 aa  1197    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1386  anthranilate synthase  48.29 
 
 
726 aa  634  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3982  anthranilate synthase  48.05 
 
 
715 aa  626  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.758299  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1688  anthranilate synthase  48.74 
 
 
738 aa  622  1e-177  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.231045 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3546  anthranilate synthase  49.86 
 
 
728 aa  620  1e-176  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1439  anthranilate synthase  46.06 
 
 
742 aa  595  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0498  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  33.54 
 
 
642 aa  223  8e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3523  aminotransferase class IV  32.36 
 
 
673 aa  209  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600789  hitchhiker  0.0000706242 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2940  anthranilate synthase component I  36.43 
 
 
471 aa  204  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.256099 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1455  anthranilate synthase component I  44.06 
 
 
514 aa  202  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.686129 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0342  anthranilate synthase component I  35.68 
 
 
469 aa  201  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0367738  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2156  anthranilate synthase component I  44.06 
 
 
517 aa  201  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.849379  hitchhiker  0.00323016 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1255  anthranilate synthase component I  36.41 
 
 
500 aa  200  9e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0248  anthranilate synthase component I  35.2 
 
 
507 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0983  anthranilate synthase component I  34.78 
 
 
474 aa  191  5.999999999999999e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.371518  normal  0.264118 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1399  anthranilate synthase, component I  32.76 
 
 
508 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0466701  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1582  anthranilate synthase component I  33.79 
 
 
491 aa  189  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000405168  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0228  anthranilate synthase  35.81 
 
 
515 aa  188  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0906  anthranilate synthase component I  32.24 
 
 
493 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000348371  hitchhiker  0.00000000636534 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4378  anthranilate synthase component I  33.96 
 
 
503 aa  186  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3907  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.58 
 
 
472 aa  184  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177197  normal  0.165975 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2547  anthranilate synthase component I  33.08 
 
 
491 aa  183  8.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000521944  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4276  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.33 
 
 
466 aa  182  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1154  anthranilate synthase component I  31.63 
 
 
545 aa  182  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2950  anthranilate synthase component I  33.85 
 
 
525 aa  182  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427522  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1191  anthranilate synthase component I  33.7 
 
 
487 aa  182  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00517718  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0064  anthranilate synthase  31.52 
 
 
465 aa  182  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5398  anthranilate synthase component I  33.76 
 
 
504 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5240  para-aminobenzoate synthase, component I  30.67 
 
 
465 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0076  para-aminobenzoate synthase, component I  32.05 
 
 
465 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1060  anthranilate synthase component I  29.53 
 
 
554 aa  179  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0875  anthranilate synthase, component I  30.96 
 
 
494 aa  179  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000225677  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2369  anthranilate synthase component I  34.36 
 
 
493 aa  179  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2108  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  34.62 
 
 
466 aa  179  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1162  anthranilate synthase component I  34.51 
 
 
485 aa  179  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3368  anthranilate synthase component I  36.31 
 
 
493 aa  179  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.082923  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2413  anthranilate synthase component I  31.25 
 
 
491 aa  178  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1342  anthranilate synthase, component I  35.75 
 
 
499 aa  178  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00981315  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1804  anthranilate synthase component I  33.06 
 
 
491 aa  178  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0147265 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1869  anthranilate synthase component I  31.96 
 
 
475 aa  177  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2962  anthranilate synthase component I  34.93 
 
 
505 aa  177  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00182854  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0796  anthranilate synthase component I  29.8 
 
 
523 aa  177  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4120  anthranilate synthase, component I  34.51 
 
 
489 aa  177  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1785  anthranilate synthase  33.78 
 
 
505 aa  177  6e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3481  anthranilate synthase component I  32.88 
 
 
491 aa  176  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1149  anthranilate synthase, component I  29.84 
 
 
506 aa  176  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2228  anthranilate synthase, component I  33.6 
 
 
521 aa  176  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0067  para-aminobenzoate synthase component I  30.85 
 
 
480 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2143  anthranilate synthase component I  32.71 
 
 
508 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.105763  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1731  anthranilate synthase component I  32.8 
 
 
491 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5573  anthranilate synthase component I  31.96 
 
 
504 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0068  para-aminobenzoate synthase component I  30.41 
 
 
465 aa  174  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0064  para-aminobenzoate synthase component I  30.41 
 
 
465 aa  174  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0064  para-aminobenzoate synthase component I  30.41 
 
 
465 aa  174  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0077  para-aminobenzoate synthase, component I  30.41 
 
 
465 aa  174  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000409192 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0068  para-aminobenzoate synthase component I  30.41 
 
 
465 aa  174  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0080  para-aminobenzoate synthase, component I  30.41 
 
 
465 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1932  anthranilate synthase component I  30.97 
 
 
520 aa  173  9e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1891  anthranilate synthase component I  39.25 
 
 
504 aa  172  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00894891  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3102  anthranilate synthase component I  32.15 
 
 
506 aa  173  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.978454 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20231  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  29.61 
 
 
506 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2383  anthranilate synthase component I  31.3 
 
 
491 aa  172  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2021  anthranilate synthase, component I  33.25 
 
 
511 aa  172  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0405957  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003088  anthranilate synthase aminase component  29.13 
 
 
525 aa  172  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.823662  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2352  anthranilate synthase, component I  33.52 
 
 
503 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0156  anthranilate synthase component I  31.42 
 
 
522 aa  172  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.970752  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02758  anthranilate synthase component I  31.47 
 
 
521 aa  171  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2472  anthranilate synthase  38.08 
 
 
532 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1174  anthranilate synthase component I  31.16 
 
 
505 aa  171  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.917555  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0064  para-aminobenzoate synthase component I  32.24 
 
 
465 aa  172  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2306  anthranilate synthase component I  31.9 
 
 
520 aa  171  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1448  anthranilate synthase component I  32.91 
 
 
506 aa  172  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.307224  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0219  Anthranilate synthase  39.02 
 
 
517 aa  171  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0926  anthranilate synthase component I  33.43 
 
 
490 aa  171  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5704  anthranilate synthase component I  32.88 
 
 
513 aa  171  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  31.88 
 
 
468 aa  171  5e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2846  anthranilate synthase component I  32.97 
 
 
505 aa  171  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0361965  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3245  anthranilate synthase component I  32.97 
 
 
505 aa  171  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.459901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>