More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1060 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1060  anthranilate synthase component I  100 
 
 
554 aa  1147    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02758  anthranilate synthase component I  57.7 
 
 
521 aa  598  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003088  anthranilate synthase aminase component  57.7 
 
 
525 aa  600  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.823662  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2829  anthranilate synthase component I  58 
 
 
544 aa  593  1e-168  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1154  anthranilate synthase component I  57.82 
 
 
545 aa  591  1e-167  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0796  anthranilate synthase component I  58.51 
 
 
523 aa  591  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02288  anthranilate synthase component I  54.93 
 
 
562 aa  588  1e-166  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715419  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1429  anthranilate synthase component I  58.17 
 
 
523 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2722  anthranilate synthase component I  55.58 
 
 
567 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1590  anthranilate synthase component I  57.7 
 
 
527 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1686  anthranilate synthase component I  57.34 
 
 
519 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2450  anthranilate synthase component I  56.76 
 
 
546 aa  568  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3019  anthranilate synthase component I  55.92 
 
 
574 aa  565  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2701  anthranilate synthase component I  53.82 
 
 
564 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2912  anthranilate synthase component I  57.45 
 
 
519 aa  568  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.598072 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2403  anthranilate synthase component I  56.7 
 
 
541 aa  565  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.427733  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1462  anthranilate synthase component I  56.3 
 
 
569 aa  568  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1528  anthranilate synthase component I  56.49 
 
 
569 aa  566  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.373649  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1520  anthranilate synthase component I  56.54 
 
 
563 aa  566  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0360897 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2801  anthranilate synthase component I  56.2 
 
 
559 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1932  anthranilate synthase component I  55.15 
 
 
521 aa  561  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.924364  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1664  anthranilate synthase component I  55.19 
 
 
564 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00684906  hitchhiker  0.0000845967 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2042  anthranilate synthase component I  55.15 
 
 
521 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.568507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2312  anthranilate synthase component I  55.15 
 
 
521 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2251  anthranilate synthase component I  57.06 
 
 
517 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00473721 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1605  anthranilate synthase component I  54.81 
 
 
520 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.443711  hitchhiker  0.000400444 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1850  anthranilate synthase component I  54.81 
 
 
520 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.174926  hitchhiker  0.00154375 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1913  anthranilate synthase component I  54.81 
 
 
520 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000288836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1423  anthranilate synthase component I  54.81 
 
 
520 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1489  anthranilate synthase component I  53.92 
 
 
520 aa  557  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1855  anthranilate synthase component I  54.62 
 
 
520 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.945253  normal  0.19487 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1463  anthranilate synthase component I  54.3 
 
 
520 aa  556  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40703  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01238  anthranilate synthase component I  54.3 
 
 
520 aa  554  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2384  anthranilate synthase component I  54.3 
 
 
520 aa  552  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00032032  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1896  anthranilate synthase component I  53.54 
 
 
520 aa  552  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481284 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2306  anthranilate synthase component I  54.49 
 
 
520 aa  551  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01248  hypothetical protein  54.3 
 
 
520 aa  554  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1932  anthranilate synthase component I  53.65 
 
 
520 aa  550  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1373  anthranilate synthase component I  53.54 
 
 
520 aa  551  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2363  anthranilate synthase component I  53.54 
 
 
520 aa  551  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000438966 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1868  anthranilate synthase component I  53.92 
 
 
520 aa  549  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000112472 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2129  anthranilate synthase component I  55.25 
 
 
527 aa  550  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.777087 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2007  anthranilate synthase component I  54.11 
 
 
520 aa  546  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.599068  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2172  anthranilate synthase component I  53.65 
 
 
520 aa  543  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2667  anthranilate synthase component I  54.47 
 
 
520 aa  545  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2204  anthranilate synthase component I  54.19 
 
 
520 aa  541  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00459304 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3522  anthranilate synthase component I  53.09 
 
 
547 aa  527  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51360  anthranilate synthase component I  45.88 
 
 
530 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.667979  hitchhiker  0.000188045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4397  anthranilate synthase component I  46.12 
 
 
491 aa  425  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1455  anthranilate synthase component I  39.37 
 
 
514 aa  283  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.686129 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2156  anthranilate synthase component I  38.27 
 
 
517 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.849379  hitchhiker  0.00323016 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0875  anthranilate synthase, component I  38.46 
 
 
494 aa  271  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000225677  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1255  anthranilate synthase component I  36.92 
 
 
500 aa  264  3e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3245  anthranilate synthase component I  39.33 
 
 
505 aa  263  8.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.459901  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2846  anthranilate synthase component I  39.33 
 
 
505 aa  263  8.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0361965  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0761  anthranilate synthase component I  38.73 
 
 
539 aa  260  5.0000000000000005e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.061947  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2120  anthranilate synthase component I  35.62 
 
 
503 aa  259  7e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.016796 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4120  anthranilate synthase, component I  41.27 
 
 
489 aa  259  8e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1869  anthranilate synthase component I  40.32 
 
 
475 aa  258  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0983  anthranilate synthase component I  42.09 
 
 
474 aa  256  5e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.371518  normal  0.264118 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5704  anthranilate synthase component I  38.37 
 
 
513 aa  256  7e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3213  anthranilate synthase component I  37.5 
 
 
488 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0493446  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2584  anthranilate synthase component I  36.99 
 
 
495 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1251  anthranilate/para-aminobenzoate synthass component I  37.97 
 
 
485 aa  253  5.000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1042  anthranilate synthase component I  40.94 
 
 
496 aa  252  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2250  anthranilate synthase component I  36.64 
 
 
502 aa  250  4e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.327103  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1481  anthranilate synthase component I  37.93 
 
 
485 aa  248  1e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1731  anthranilate synthase component I  40.16 
 
 
491 aa  248  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2323  anthranilate synthase, component I  38.06 
 
 
518 aa  247  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.933209  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0783  anthranilate synthase component I  37.5 
 
 
457 aa  247  3e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0095875  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0806  anthranilate synthase component I  37.5 
 
 
457 aa  247  3e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.354232  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1271  anthranilate synthase, component I  37.93 
 
 
485 aa  247  4e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2950  anthranilate synthase component I  40.62 
 
 
525 aa  247  4.9999999999999997e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427522  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2962  anthranilate synthase component I  38.4 
 
 
505 aa  246  8e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00182854  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0476  anthranilate synthase component I  35.8 
 
 
508 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3621  anthranilate synthase component I  39.15 
 
 
497 aa  244  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2227  anthranilate synthase component I  36.47 
 
 
520 aa  244  3.9999999999999997e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2132  anthranilate synthase component I  46.49 
 
 
500 aa  244  3.9999999999999997e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0926  anthranilate synthase component I  38.82 
 
 
490 aa  243  5e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0071  anthranilate synthase  37.44 
 
 
417 aa  243  5e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2115  anthranilate synthase, component I  38.59 
 
 
509 aa  243  5e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.332687  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2853  anthranilate synthase component I  39.32 
 
 
500 aa  243  7e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2547  anthranilate synthase component I  38.71 
 
 
491 aa  243  9e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000521944  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0266  anthranilate synthase component I  38.93 
 
 
501 aa  242  1e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3517  anthranilate synthase component I  39.69 
 
 
495 aa  242  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.789365  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5714  anthranilate synthase component I  37.5 
 
 
516 aa  242  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14850  anthranilate synthase, component I  38.46 
 
 
512 aa  242  1e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000119125  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2698  anthranilate synthase component I  39.1 
 
 
497 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1162  anthranilate synthase component I  37.07 
 
 
485 aa  241  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1291  anthranilate synthase component I  38.21 
 
 
472 aa  241  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1191  anthranilate synthase component I  38.19 
 
 
487 aa  242  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00517718  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1582  anthranilate synthase component I  38.93 
 
 
491 aa  241  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000405168  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0463  anthranilate synthase component I  38.24 
 
 
497 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.612638  normal  0.521627 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1143  anthranilate synthase component I  48.46 
 
 
503 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0793229 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2571  anthranilate synthase component I  38.89 
 
 
497 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0439  anthranilate synthase component I  38.24 
 
 
497 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.629503  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0534  anthranilate synthase component I  38.89 
 
 
497 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0506  anthranilate synthase component I  38.89 
 
 
497 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.978551 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1144  anthranilate synthase component I  38.21 
 
 
472 aa  240  4e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000269912  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3368  anthranilate synthase component I  37.9 
 
 
493 aa  240  5e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.082923  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>