More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003088 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003088  anthranilate synthase aminase component  100 
 
 
525 aa  1087    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.823662  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1154  anthranilate synthase component I  68.88 
 
 
545 aa  726    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0796  anthranilate synthase component I  78.03 
 
 
523 aa  827    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02758  anthranilate synthase component I  96.14 
 
 
521 aa  1032    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1605  anthranilate synthase component I  60.95 
 
 
520 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.443711  hitchhiker  0.000400444 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1855  anthranilate synthase component I  60.95 
 
 
520 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.945253  normal  0.19487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1913  anthranilate synthase component I  60.95 
 
 
520 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000288836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1850  anthranilate synthase component I  60.95 
 
 
520 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.174926  hitchhiker  0.00154375 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1932  anthranilate synthase component I  61.42 
 
 
521 aa  619  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.924364  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1423  anthranilate synthase component I  60.75 
 
 
520 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2042  anthranilate synthase component I  61.22 
 
 
521 aa  618  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.568507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2312  anthranilate synthase component I  61.22 
 
 
521 aa  618  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1932  anthranilate synthase component I  60.59 
 
 
520 aa  610  1e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1489  anthranilate synthase component I  59.72 
 
 
520 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2363  anthranilate synthase component I  59.72 
 
 
520 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000438966 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1373  anthranilate synthase component I  59.72 
 
 
520 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2306  anthranilate synthase component I  60.31 
 
 
520 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2007  anthranilate synthase component I  60.59 
 
 
520 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.599068  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2172  anthranilate synthase component I  60.16 
 
 
520 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1463  anthranilate synthase component I  60.12 
 
 
520 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40703  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01238  anthranilate synthase component I  60.51 
 
 
520 aa  599  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2384  anthranilate synthase component I  60.51 
 
 
520 aa  599  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00032032  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1896  anthranilate synthase component I  59.53 
 
 
520 aa  598  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481284 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1868  anthranilate synthase component I  60.12 
 
 
520 aa  598  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000112472 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2204  anthranilate synthase component I  60.04 
 
 
520 aa  599  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00459304 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01248  hypothetical protein  60.51 
 
 
520 aa  599  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1060  anthranilate synthase component I  57.7 
 
 
554 aa  600  1e-170  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2667  anthranilate synthase component I  58.46 
 
 
520 aa  594  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02288  anthranilate synthase component I  56.8 
 
 
562 aa  593  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715419  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2829  anthranilate synthase component I  56.6 
 
 
544 aa  590  1e-167  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2251  anthranilate synthase component I  56.98 
 
 
517 aa  581  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00473721 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1528  anthranilate synthase component I  56.73 
 
 
569 aa  578  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.373649  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1462  anthranilate synthase component I  56.73 
 
 
569 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1520  anthranilate synthase component I  56.61 
 
 
563 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0360897 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3019  anthranilate synthase component I  55.38 
 
 
574 aa  569  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2701  anthranilate synthase component I  55.81 
 
 
564 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1590  anthranilate synthase component I  57.03 
 
 
527 aa  569  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2403  anthranilate synthase component I  55.51 
 
 
541 aa  565  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.427733  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2722  anthranilate synthase component I  55.71 
 
 
567 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2801  anthranilate synthase component I  55.92 
 
 
559 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2912  anthranilate synthase component I  56.4 
 
 
519 aa  566  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.598072 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1664  anthranilate synthase component I  55.73 
 
 
564 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00684906  hitchhiker  0.0000845967 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1686  anthranilate synthase component I  55.66 
 
 
519 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2450  anthranilate synthase component I  54.6 
 
 
546 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2129  anthranilate synthase component I  55.34 
 
 
527 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.777087 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1429  anthranilate synthase component I  55.66 
 
 
523 aa  560  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3522  anthranilate synthase component I  53.52 
 
 
547 aa  545  1e-154  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51360  anthranilate synthase component I  50.31 
 
 
530 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.667979  hitchhiker  0.000188045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4397  anthranilate synthase component I  49.06 
 
 
491 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1455  anthranilate synthase component I  39.25 
 
 
514 aa  280  4e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.686129 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4120  anthranilate synthase, component I  43.35 
 
 
489 aa  279  8e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2156  anthranilate synthase component I  41.23 
 
 
517 aa  279  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.849379  hitchhiker  0.00323016 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1255  anthranilate synthase component I  37.7 
 
 
500 aa  276  8e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0071  anthranilate synthase  39.81 
 
 
417 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0983  anthranilate synthase component I  41.76 
 
 
474 aa  270  5.9999999999999995e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.371518  normal  0.264118 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0761  anthranilate synthase component I  41.98 
 
 
539 aa  268  2.9999999999999995e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.061947  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2846  anthranilate synthase component I  38.85 
 
 
505 aa  266  5e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0361965  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3245  anthranilate synthase component I  38.85 
 
 
505 aa  266  5e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.459901  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2962  anthranilate synthase component I  40.84 
 
 
505 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00182854  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0875  anthranilate synthase, component I  38.46 
 
 
494 aa  266  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000225677  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1042  anthranilate synthase component I  39.8 
 
 
496 aa  265  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1162  anthranilate synthase component I  41.13 
 
 
485 aa  265  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1249  anthranilate synthase component I  41.64 
 
 
492 aa  265  2e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.261979  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2940  anthranilate synthase component I  41.6 
 
 
471 aa  265  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.256099 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0476  anthranilate synthase component I  38.69 
 
 
508 aa  264  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1481  anthranilate synthase component I  38.26 
 
 
485 aa  263  6e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1251  anthranilate/para-aminobenzoate synthass component I  38.58 
 
 
485 aa  263  6.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1856  anthranilate synthase, component I  36.67 
 
 
512 aa  261  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.415025  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1271  anthranilate synthase, component I  38.26 
 
 
485 aa  262  1e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1731  anthranilate synthase component I  38.31 
 
 
491 aa  261  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0747  anthranilate synthase, component I  38.78 
 
 
493 aa  259  6e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2497  anthranilate synthase, component I  40.26 
 
 
491 aa  257  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0266  anthranilate synthase component I  38.03 
 
 
501 aa  258  3e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1869  anthranilate synthase component I  37.44 
 
 
475 aa  257  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0926  anthranilate synthase component I  40.79 
 
 
490 aa  256  7e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2584  anthranilate synthase component I  37.91 
 
 
495 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2250  anthranilate synthase component I  40.1 
 
 
502 aa  255  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.327103  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3368  anthranilate synthase component I  40.32 
 
 
493 aa  254  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.082923  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0248  anthranilate synthase component I  41.9 
 
 
507 aa  254  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2547  anthranilate synthase component I  39.16 
 
 
491 aa  254  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000521944  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2323  anthranilate synthase, component I  40.15 
 
 
518 aa  254  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.933209  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2143  anthranilate synthase component I  34.78 
 
 
508 aa  254  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.105763  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1191  anthranilate synthase component I  40.21 
 
 
487 aa  253  5.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00517718  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1122  anthranilate synthase, component I  40.5 
 
 
496 aa  252  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00596141  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0730  anthranilate synthase, component I  39.56 
 
 
494 aa  251  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1891  anthranilate synthase component I  37.32 
 
 
504 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00894891  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0342  anthranilate synthase component I  39.79 
 
 
469 aa  251  3e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0367738  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0148  anthranilate synthase component I  37.59 
 
 
501 aa  251  3e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2877  anthranilate synthase component I  38.08 
 
 
489 aa  250  4e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1582  anthranilate synthase component I  37.41 
 
 
491 aa  250  4e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000405168  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2383  anthranilate synthase component I  39.74 
 
 
491 aa  250  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1804  anthranilate synthase component I  40.16 
 
 
491 aa  250  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0147265 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1144  anthranilate synthase component I  36.57 
 
 
472 aa  250  6e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000269912  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2413  anthranilate synthase component I  40.16 
 
 
491 aa  249  8e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1342  anthranilate synthase, component I  38 
 
 
499 aa  249  8e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00981315  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2082  anthranilate synthase component I  34.69 
 
 
491 aa  248  2e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04195  anthranilate synthase component I  37.41 
 
 
491 aa  248  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2950  anthranilate synthase component I  41.43 
 
 
525 aa  248  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427522  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1291  anthranilate synthase component I  38.48 
 
 
472 aa  248  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1783  anthranilate synthase component I  35.63 
 
 
498 aa  247  4e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.589436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>