More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2007 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01238  anthranilate synthase component I  77.69 
 
 		 520 aa  801    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2384  anthranilate synthase component I  77.69 
 
 		 520 aa  802    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00032032  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1932  anthranilate synthase component I  87.31 
 
 		 520 aa  937    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2312  anthranilate synthase component I  81.54 
 
 		 521 aa  876    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1373  anthranilate synthase component I  77.5 
 
 		 520 aa  817    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1489  anthranilate synthase component I  77.88 
 
 		 520 aa  825    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01248  hypothetical protein  77.69 
 
 		 520 aa  801    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2306  anthranilate synthase component I  97.31 
 
 		 520 aa  1008    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1850  anthranilate synthase component I  77.69 
 
 		 520 aa  823    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.174926  hitchhiker  0.00154375 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1896  anthranilate synthase component I  77.69 
 
 		 520 aa  821    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000481284 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1868  anthranilate synthase component I  77.69 
 
 		 520 aa  804    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000112472 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1855  anthranilate synthase component I  77.69 
 
 		 520 aa  824    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.945253  normal  0.19487 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1423  anthranilate synthase component I  77.69 
 
 		 520 aa  822    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2204  anthranilate synthase component I  78.65 
 
 		 520 aa  818    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00459304 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2007  anthranilate synthase component I  100 
 
 		 520 aa  1064    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.599068  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1913  anthranilate synthase component I  77.69 
 
 		 520 aa  823    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000288836 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1605  anthranilate synthase component I  77.69 
 
 		 520 aa  823    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.443711  hitchhiker  0.000400444 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1463  anthranilate synthase component I  77.69 
 
 		 520 aa  822    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40703  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1932  anthranilate synthase component I  81.73 
 
 		 521 aa  877    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.924364  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2042  anthranilate synthase component I  81.54 
 
 		 521 aa  876    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.568507  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2172  anthranilate synthase component I  88.27 
 
 		 520 aa  940    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2363  anthranilate synthase component I  77.5 
 
 		 520 aa  817    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000438966 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2667  anthranilate synthase component I  82.69 
 
 		 520 aa  856    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0796  anthranilate synthase component I  60.42 
 
 		 523 aa  625  1e-178  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02758  anthranilate synthase component I  60.67 
 
 		 521 aa  615  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003088  anthranilate synthase aminase component  60.59 
 
 		 525 aa  611  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.823662  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1154  anthranilate synthase component I  58.44 
 
 		 545 aa  606  9.999999999999999e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2829  anthranilate synthase component I  56.67 
 
 		 544 aa  578  1e-164  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02288  anthranilate synthase component I  54.6 
 
 		 562 aa  573  1.0000000000000001e-162  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715419  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1060  anthranilate synthase component I  54.11 
 
 		 554 aa  553  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3019  anthranilate synthase component I  53.93 
 
 		 574 aa  536  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2129  anthranilate synthase component I  55.6 
 
 		 527 aa  534  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.777087 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2912  anthranilate synthase component I  54.78 
 
 		 519 aa  529  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.598072 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1528  anthranilate synthase component I  53.37 
 
 		 569 aa  525  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.373649  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2251  anthranilate synthase component I  54.26 
 
 		 517 aa  518  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00473721 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2450  anthranilate synthase component I  54.02 
 
 		 546 aa  519  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1462  anthranilate synthase component I  53.02 
 
 		 569 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1520  anthranilate synthase component I  53.4 
 
 		 563 aa  519  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0360897 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1590  anthranilate synthase component I  54.06 
 
 		 527 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3522  anthranilate synthase component I  52.17 
 
 		 547 aa  516  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2801  anthranilate synthase component I  52.84 
 
 		 559 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2403  anthranilate synthase component I  53.46 
 
 		 541 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.427733  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2701  anthranilate synthase component I  52.73 
 
 		 564 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1686  anthranilate synthase component I  54.31 
 
 		 519 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2722  anthranilate synthase component I  53.77 
 
 		 567 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1664  anthranilate synthase component I  52.54 
 
 		 564 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00684906  hitchhiker  0.0000845967 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1429  anthranilate synthase component I  54.29 
 
 		 523 aa  513  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51360  anthranilate synthase component I  49.89 
 
 		 530 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.667979  hitchhiker  0.000188045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4397  anthranilate synthase component I  49.68 
 
 		 491 aa  435  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28130  anthranilate synthase component I  38.63 
 
 		 517 aa  290  3e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2950  anthranilate synthase component I  38.37 
 
 		 525 aa  285  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427522  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1455  anthranilate synthase component I  42.54 
 
 		 514 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686129 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2156  anthranilate synthase component I  43.46 
 
 		 517 aa  280  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.849379  hitchhiker  0.00323016 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1255  anthranilate synthase component I  42.04 
 
 		 500 aa  278  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2497  anthranilate synthase, component I  41.62 
 
 		 491 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0730  anthranilate synthase, component I  43.19 
 
 		 494 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5704  anthranilate synthase component I  44.15 
 
 		 513 aa  275  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4120  anthranilate synthase, component I  43.13 
 
 		 489 aa  272  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3400  anthranilate synthase component I  37.67 
 
 		 517 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.387775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5714  anthranilate synthase component I  38.18 
 
 		 516 aa  270  5.9999999999999995e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1481  anthranilate synthase component I  41.22 
 
 		 485 aa  270  7e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2846  anthranilate synthase component I  40.51 
 
 		 505 aa  268  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0361965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3245  anthranilate synthase component I  40.51 
 
 		 505 aa  268  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.459901  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1271  anthranilate synthase, component I  41.22 
 
 		 485 aa  268  2e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1731  anthranilate synthase component I  42.15 
 
 		 491 aa  268  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1251  anthranilate/para-aminobenzoate synthass component I  41.32 
 
 		 485 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0228  anthranilate synthase  41.12 
 
 		 515 aa  268  2.9999999999999995e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1191  anthranilate synthase component I  44.24 
 
 		 487 aa  266  5e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00517718  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2940  anthranilate synthase component I  40.9 
 
 		 471 aa  265  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.256099 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2962  anthranilate synthase component I  40 
 
 		 505 aa  265  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00182854  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3175  anthranilate synthase component I  42.78 
 
 		 517 aa  264  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.491982 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0248  anthranilate synthase component I  39.9 
 
 		 507 aa  263  8e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1582  anthranilate synthase component I  39.71 
 
 		 491 aa  263  8e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000405168  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0690  Anthranilate synthase  42.25 
 
 		 465 aa  262  1e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0761  anthranilate synthase component I  41.62 
 
 		 539 aa  262  1e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.061947  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0983  anthranilate synthase component I  43.21 
 
 		 474 aa  262  1e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.371518  normal  0.264118 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2120  anthranilate synthase component I  41.24 
 
 		 503 aa  261  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.016796 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0071  anthranilate synthase  40.05 
 
 		 417 aa  261  2e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3368  anthranilate synthase component I  42.97 
 
 		 493 aa  260  3e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.082923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1122  anthranilate synthase, component I  40 
 
 		 496 aa  261  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00596141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0875  anthranilate synthase, component I  38.99 
 
 		 494 aa  260  4e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000225677  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2250  anthranilate synthase component I  41.71 
 
 		 502 aa  260  4e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.327103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2227  anthranilate synthase component I  34.56 
 
 		 520 aa  260  5.0000000000000005e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1992  anthranilate synthase component I  35.41 
 
 		 525 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.221966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1869  anthranilate synthase component I  40 
 
 		 475 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2547  anthranilate synthase component I  41.13 
 
 		 491 aa  259  7e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000521944  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2383  anthranilate synthase component I  40.26 
 
 		 491 aa  259  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1042  anthranilate synthase component I  37.6 
 
 		 496 aa  258  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1162  anthranilate synthase component I  39.25 
 
 		 485 aa  259  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11625  anthranilate synthase component I  37.65 
 
 		 516 aa  258  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.167744 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4721  anthranilate synthase, component I  34.54 
 
 		 504 aa  258  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2044  anthranilate synthase component I  35.67 
 
 		 521 aa  257  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04195  anthranilate synthase component I  39.29 
 
 		 491 aa  256  5e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0342  anthranilate synthase component I  40.91 
 
 		 469 aa  256  6e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0367738  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1212  anthranilate synthase component I  33.97 
 
 		 525 aa  256  6e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.14858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1246  anthranilate synthase component I  36.82 
 
 		 492 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3579  anthranilate synthase component I  39.44 
 
 		 574 aa  253  4.0000000000000004e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.736027  normal  0.0487715 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2584  anthranilate synthase component I  38.32 
 
 		 495 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3220  anthranilate synthase component I  36.66 
 
 		 498 aa  253  6e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.935253  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1804  anthranilate synthase component I  40.89 
 
 		 491 aa  253  8.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0147265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>