More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2829 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02288  anthranilate synthase component I  66.24 
 
 
562 aa  720    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715419  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2829  anthranilate synthase component I  100 
 
 
544 aa  1123    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1154  anthranilate synthase component I  58.8 
 
 
545 aa  600  1e-170  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3522  anthranilate synthase component I  58 
 
 
547 aa  598  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2722  anthranilate synthase component I  56.47 
 
 
567 aa  591  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2912  anthranilate synthase component I  58.14 
 
 
519 aa  592  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.598072 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2701  anthranilate synthase component I  56.17 
 
 
564 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1060  anthranilate synthase component I  58 
 
 
554 aa  593  1e-168  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1664  anthranilate synthase component I  56.09 
 
 
564 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00684906  hitchhiker  0.0000845967 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2801  anthranilate synthase component I  57.44 
 
 
559 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003088  anthranilate synthase aminase component  56.6 
 
 
525 aa  590  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.823662  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2403  anthranilate synthase component I  57.12 
 
 
541 aa  587  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.427733  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1686  anthranilate synthase component I  59.88 
 
 
519 aa  587  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2251  anthranilate synthase component I  58.77 
 
 
517 aa  586  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00473721 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1429  anthranilate synthase component I  57.83 
 
 
523 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0796  anthranilate synthase component I  56.66 
 
 
523 aa  582  1.0000000000000001e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02758  anthranilate synthase component I  56.25 
 
 
521 aa  581  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1590  anthranilate synthase component I  57.03 
 
 
527 aa  581  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1528  anthranilate synthase component I  54.86 
 
 
569 aa  578  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.373649  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2172  anthranilate synthase component I  56.67 
 
 
520 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3019  anthranilate synthase component I  55.78 
 
 
574 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2312  anthranilate synthase component I  56.48 
 
 
521 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2042  anthranilate synthase component I  56.48 
 
 
521 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.568507  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2450  anthranilate synthase component I  57.3 
 
 
546 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1932  anthranilate synthase component I  56.09 
 
 
520 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1462  anthranilate synthase component I  55.97 
 
 
569 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1520  anthranilate synthase component I  56.84 
 
 
563 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0360897 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1463  anthranilate synthase component I  56.79 
 
 
520 aa  570  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40703  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1489  anthranilate synthase component I  56.79 
 
 
520 aa  571  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2363  anthranilate synthase component I  56.79 
 
 
520 aa  570  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000438966 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2306  anthranilate synthase component I  56.87 
 
 
520 aa  571  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1373  anthranilate synthase component I  56.79 
 
 
520 aa  570  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1932  anthranilate synthase component I  56.29 
 
 
521 aa  570  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.924364  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1896  anthranilate synthase component I  56.6 
 
 
520 aa  566  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481284 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2129  anthranilate synthase component I  56.71 
 
 
527 aa  566  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.777087 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01238  anthranilate synthase component I  57.17 
 
 
520 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2384  anthranilate synthase component I  57.17 
 
 
520 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00032032  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01248  hypothetical protein  57.17 
 
 
520 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2007  anthranilate synthase component I  56.67 
 
 
520 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.599068  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1868  anthranilate synthase component I  56.79 
 
 
520 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000112472 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1423  anthranilate synthase component I  56.4 
 
 
520 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1913  anthranilate synthase component I  56.59 
 
 
520 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000288836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1850  anthranilate synthase component I  56.59 
 
 
520 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.174926  hitchhiker  0.00154375 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1855  anthranilate synthase component I  56.59 
 
 
520 aa  565  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.945253  normal  0.19487 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1605  anthranilate synthase component I  56.59 
 
 
520 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.443711  hitchhiker  0.000400444 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2204  anthranilate synthase component I  56.29 
 
 
520 aa  561  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00459304 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2667  anthranilate synthase component I  54.3 
 
 
520 aa  547  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51360  anthranilate synthase component I  47.28 
 
 
530 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.667979  hitchhiker  0.000188045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4397  anthranilate synthase component I  45.82 
 
 
491 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4120  anthranilate synthase, component I  37.45 
 
 
489 aa  291  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1255  anthranilate synthase component I  39.45 
 
 
500 aa  288  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1455  anthranilate synthase component I  38.86 
 
 
514 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.686129 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2547  anthranilate synthase component I  37.32 
 
 
491 aa  276  7e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000521944  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1251  anthranilate/para-aminobenzoate synthass component I  39.1 
 
 
485 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2156  anthranilate synthase component I  33.87 
 
 
517 aa  273  6e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.849379  hitchhiker  0.00323016 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1731  anthranilate synthase component I  37.34 
 
 
491 aa  272  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2962  anthranilate synthase component I  42.24 
 
 
505 aa  271  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00182854  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1481  anthranilate synthase component I  38.24 
 
 
485 aa  270  5.9999999999999995e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1582  anthranilate synthase component I  36.83 
 
 
491 aa  270  7e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000405168  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1271  anthranilate synthase, component I  38.24 
 
 
485 aa  269  1e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1191  anthranilate synthase component I  41.6 
 
 
487 aa  267  5e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00517718  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0906  anthranilate synthase component I  36.61 
 
 
493 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000348371  hitchhiker  0.00000000636534 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2950  anthranilate synthase component I  37.21 
 
 
525 aa  265  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427522  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2120  anthranilate synthase component I  39.03 
 
 
503 aa  265  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.016796 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1042  anthranilate synthase component I  38.64 
 
 
496 aa  264  3e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0730  anthranilate synthase, component I  36.94 
 
 
494 aa  264  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0747  anthranilate synthase, component I  36.94 
 
 
493 aa  263  4.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2044  anthranilate synthase component I  37.2 
 
 
521 aa  263  4.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2846  anthranilate synthase component I  35.45 
 
 
505 aa  261  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0361965  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3245  anthranilate synthase component I  35.45 
 
 
505 aa  261  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.459901  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0875  anthranilate synthase, component I  38.42 
 
 
494 aa  260  4e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000225677  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0983  anthranilate synthase component I  41.53 
 
 
474 aa  260  4e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.371518  normal  0.264118 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0761  anthranilate synthase component I  36.84 
 
 
539 aa  259  6e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.061947  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1804  anthranilate synthase component I  36.82 
 
 
491 aa  259  6e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0147265 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1403  anthranilate synthase, component I  35.65 
 
 
498 aa  259  9e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.539776  hitchhiker  0.000291394 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1869  anthranilate synthase component I  39.25 
 
 
475 aa  259  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0248  anthranilate synthase component I  38.85 
 
 
507 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2383  anthranilate synthase component I  35.74 
 
 
491 aa  256  5e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3579  anthranilate synthase component I  35.29 
 
 
574 aa  257  5e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.736027  normal  0.0487715 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28130  anthranilate synthase component I  35 
 
 
517 aa  256  7e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1246  anthranilate synthase component I  38.56 
 
 
492 aa  256  7e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2413  anthranilate synthase component I  36.4 
 
 
491 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1162  anthranilate synthase component I  39.36 
 
 
485 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0342  anthranilate synthase component I  38.35 
 
 
469 aa  255  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0367738  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14850  anthranilate synthase, component I  36.42 
 
 
512 aa  254  4.0000000000000004e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000119125  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2369  anthranilate synthase component I  40.48 
 
 
493 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3213  anthranilate synthase component I  39.95 
 
 
488 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0493446  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1291  anthranilate synthase component I  37.86 
 
 
472 aa  253  6e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1143  anthranilate synthase component I  40.55 
 
 
503 aa  253  8.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0793229 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3078  anthranilate synthase component I  35.96 
 
 
535 aa  252  9.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00101032  hitchhiker  0.000123729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5704  anthranilate synthase component I  39.49 
 
 
513 aa  253  9.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2853  anthranilate synthase component I  35.77 
 
 
500 aa  253  9.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1144  anthranilate synthase component I  37.6 
 
 
472 aa  252  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000269912  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2497  anthranilate synthase, component I  39.06 
 
 
491 aa  252  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0690  Anthranilate synthase  39.41 
 
 
465 aa  252  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1393  anthranilate synthase component I  39.15 
 
 
472 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000022114  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3602  anthranilate synthase component I  41.07 
 
 
508 aa  251  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148563  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0476  anthranilate synthase component I  36.38 
 
 
508 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0568  anthranilate synthase, component I  38.38 
 
 
493 aa  251  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3722  anthranilate synthase component I  39.63 
 
 
491 aa  251  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.803971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>