More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1143 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2004  anthranilate synthase component I  77.18 
 
 		 503 aa  731    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.271307  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3101  anthranilate synthase component I  77.58 
 
 		 503 aa  731    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1796  anthranilate synthase component I  79.68 
 
 		 509 aa  803    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00033121  normal  0.176001 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1882  anthranilate synthase component I  78.84 
 
 		 502 aa  771    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.339054  normal  0.170902 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1143  anthranilate synthase component I  100 
 
 		 503 aa  1019    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0793229 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2132  anthranilate synthase component I  74.7 
 
 		 500 aa  714    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0714  anthranilate synthase component I  77.18 
 
 		 503 aa  731    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.78181  normal  0.0623872 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3169  anthranilate synthase component I  59.68 
 
 		 502 aa  590  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276011  normal  0.09914 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1891  anthranilate synthase component I  60.04 
 
 		 504 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00894891  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4378  anthranilate synthase component I  60 
 
 		 503 aa  580  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0506  anthranilate synthase component I  58.2 
 
 		 505 aa  551  1e-156  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.640019 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3102  anthranilate synthase component I  57.37 
 
 		 506 aa  546  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.978454 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2771  anthranilate synthase component I  57.12 
 
 		 511 aa  543  1e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00110459  hitchhiker  0.00000354378 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1234  anthranilate synthase component I  55.31 
 
 		 504 aa  543  1e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0111358  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5208  anthranilate synthase component I  57.62 
 
 		 511 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.371479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1448  anthranilate synthase component I  57.14 
 
 		 506 aa  529  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.307224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5398  anthranilate synthase component I  55.36 
 
 		 504 aa  522  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5131  anthranilate synthase component I  56.44 
 
 		 506 aa  521  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.555304  normal  0.114456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5573  anthranilate synthase component I  56.15 
 
 		 504 aa  520  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950895  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1403  anthranilate synthase, component I  56.19 
 
 		 498 aa  521  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.539776  hitchhiker  0.000291394 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4668  anthranilate synthase component I  55.84 
 
 		 506 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0323578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0156  anthranilate synthase component I  51.69 
 
 		 522 aa  514  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.970752  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2021  anthranilate synthase, component I  57.93 
 
 		 511 aa  511  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0405957  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2352  anthranilate synthase, component I  53.8 
 
 		 503 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1174  anthranilate synthase component I  51.03 
 
 		 505 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.917555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2547  anthranilate synthase component I  49.29 
 
 		 491 aa  450  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000521944  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4609  anthranilate synthase component I  49 
 
 		 493 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2497  anthranilate synthase, component I  48.48 
 
 		 491 aa  437  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2383  anthranilate synthase component I  48.28 
 
 		 491 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0752  anthranilate synthase component I  50.11 
 
 		 499 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1122  anthranilate synthase, component I  47.98 
 
 		 496 aa  433  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00596141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1582  anthranilate synthase component I  47.37 
 
 		 491 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000405168  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0568  anthranilate synthase, component I  49 
 
 		 493 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3481  anthranilate synthase component I  50.1 
 
 		 491 aa  430  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1731  anthranilate synthase component I  47.53 
 
 		 491 aa  428  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1042  anthranilate synthase component I  49.9 
 
 		 496 aa  428  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0417  anthranilate synthase component I  47.49 
 
 		 493 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0753  anthranilate synthase component I  50 
 
 		 492 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.196571  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0730  anthranilate synthase, component I  45.73 
 
 		 494 aa  423  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0448  anthranilate synthase component I  47.69 
 
 		 493 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.422801  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0451  anthranilate synthase component I  47.49 
 
 		 493 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.365985 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4785  anthranilate synthase component I  47.78 
 
 		 493 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830549  normal  0.531444 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0442  anthranilate synthase component I  48.41 
 
 		 499 aa  423  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223622 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0356  anthranilate synthase component I  48.41 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0366  anthranilate synthase component I  48.41 
 
 		 519 aa  419  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1162  anthranilate synthase component I  48.71 
 
 		 485 aa  418  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2584  anthranilate synthase component I  48.58 
 
 		 495 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4721  anthranilate synthase, component I  45.83 
 
 		 504 aa  416  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5118  anthranilate synthase component I  46.99 
 
 		 492 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2413  anthranilate synthase component I  47.34 
 
 		 491 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1804  anthranilate synthase component I  47.02 
 
 		 491 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0147265 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3594  anthranilate synthase component I  45.33 
 
 		 503 aa  418  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3517  anthranilate synthase component I  47.17 
 
 		 495 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.789365  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1212  anthranilate synthase component I  46.57 
 
 		 517 aa  418  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.18446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3178  anthranilate synthase component I  46.94 
 
 		 508 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07940  anthranilate synthase component I  49.37 
 
 		 492 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127058 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2109  anthranilate synthase component I  46.25 
 
 		 502 aa  414  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.490453  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2471  anthranilate synthase, component I  48.11 
 
 		 494 aa  412  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2323  anthranilate synthase, component I  47.41 
 
 		 518 aa  415  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.933209  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3023  anthranilate synthase component I  47.12 
 
 		 505 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0594824  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46640  anthranilate synthase component I  47.71 
 
 		 492 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2877  anthranilate synthase component I  46.96 
 
 		 489 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3463  anthranilate synthase component I  47.06 
 
 		 491 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0715652 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2881  anthranilate synthase component I  46.39 
 
 		 509 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0573  anthranilate synthase component I  47.95 
 
 		 500 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0747  anthranilate synthase, component I  45.84 
 
 		 493 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3997  anthranilate synthase component I  46.46 
 
 		 496 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.346347  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3123  anthranilate synthase component I  46.37 
 
 		 510 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.274281  normal  0.443979 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0875  anthranilate synthase, component I  46.23 
 
 		 494 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000225677  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04195  anthranilate synthase component I  46.77 
 
 		 491 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2082  anthranilate synthase component I  47.97 
 
 		 491 aa  404  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2758  anthranilate synthase component I  45.72 
 
 		 510 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.654997  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0761  anthranilate synthase component I  49.69 
 
 		 539 aa  404  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.061947  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3621  anthranilate synthase component I  46.58 
 
 		 497 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0983  anthranilate synthase component I  48.85 
 
 		 474 aa  403  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.371518  normal  0.264118 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3897  anthranilate synthase component I  48.52 
 
 		 495 aa  404  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.839724 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0926  anthranilate synthase component I  48.82 
 
 		 490 aa  404  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2228  anthranilate synthase, component I  47.89 
 
 		 521 aa  401  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2494  anthranilate synthase component I  45.73 
 
 		 492 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.184686  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0377  anthranilate synthase component I  45.15 
 
 		 507 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0463  anthranilate synthase component I  46.38 
 
 		 497 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.612638  normal  0.521627 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0506  anthranilate synthase component I  46.79 
 
 		 497 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.978551 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2571  anthranilate synthase component I  46.79 
 
 		 497 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2860  anthranilate synthase component I  47 
 
 		 497 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3654  anthranilate synthase component I  46.09 
 
 		 499 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.915059 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0439  anthranilate synthase component I  46.38 
 
 		 497 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.629503  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0386  anthranilate synthase component I  45.15 
 
 		 507 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.994927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0534  anthranilate synthase component I  46.79 
 
 		 497 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3245  anthranilate synthase component I  46.61 
 
 		 505 aa  395  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.459901  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0376  anthranilate synthase component I  46.86 
 
 		 493 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.957074  normal  0.0417216 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2369  anthranilate synthase component I  47.28 
 
 		 493 aa  396  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3607  anthranilate synthase component I  46.9 
 
 		 503 aa  395  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4457  anthranilate synthase component I  44.2 
 
 		 526 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4120  anthranilate synthase, component I  45.67 
 
 		 489 aa  398  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2698  anthranilate synthase component I  45.96 
 
 		 497 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3792  anthranilate synthase, component I  44.53 
 
 		 511 aa  396  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2846  anthranilate synthase component I  46.61 
 
 		 505 aa  395  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0361965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1246  anthranilate synthase component I  42.63 
 
 		 492 aa  396  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2940  anthranilate synthase component I  47.58 
 
 		 471 aa  393  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.256099 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3722  anthranilate synthase component I  45.75 
 
 		 491 aa  394  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>