More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1462 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1590  anthranilate synthase component I  74.86 
 
 
527 aa  814    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2722  anthranilate synthase component I  82.37 
 
 
567 aa  943    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3019  anthranilate synthase component I  91.7 
 
 
574 aa  1077    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1686  anthranilate synthase component I  73.77 
 
 
519 aa  789    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2912  anthranilate synthase component I  74.01 
 
 
519 aa  796    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.598072 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2403  anthranilate synthase component I  85.55 
 
 
541 aa  949    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.427733  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2450  anthranilate synthase component I  73.37 
 
 
546 aa  806    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2701  anthranilate synthase component I  82.17 
 
 
564 aa  945    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2251  anthranilate synthase component I  74.62 
 
 
517 aa  801    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00473721 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1462  anthranilate synthase component I  100 
 
 
569 aa  1178    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1528  anthranilate synthase component I  97.72 
 
 
569 aa  1156    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.373649  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1429  anthranilate synthase component I  76.6 
 
 
523 aa  822    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2801  anthranilate synthase component I  85.1 
 
 
559 aa  943    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1520  anthranilate synthase component I  94.24 
 
 
563 aa  1082    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0360897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2129  anthranilate synthase component I  72.57 
 
 
527 aa  770    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.777087 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1664  anthranilate synthase component I  82.44 
 
 
564 aa  939    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00684906  hitchhiker  0.0000845967 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0796  anthranilate synthase component I  57.31 
 
 
523 aa  578  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003088  anthranilate synthase aminase component  56.73 
 
 
525 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.823662  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2829  anthranilate synthase component I  55.97 
 
 
544 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02758  anthranilate synthase component I  54.78 
 
 
521 aa  570  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1060  anthranilate synthase component I  56.3 
 
 
554 aa  569  1e-161  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02288  anthranilate synthase component I  54.79 
 
 
562 aa  559  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715419  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3522  anthranilate synthase component I  54.77 
 
 
547 aa  545  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1154  anthranilate synthase component I  54.95 
 
 
545 aa  540  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1932  anthranilate synthase component I  52.78 
 
 
520 aa  525  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1489  anthranilate synthase component I  53.22 
 
 
520 aa  519  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2363  anthranilate synthase component I  53.22 
 
 
520 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000438966 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1463  anthranilate synthase component I  53.22 
 
 
520 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40703  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2306  anthranilate synthase component I  53.4 
 
 
520 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1373  anthranilate synthase component I  53.22 
 
 
520 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1932  anthranilate synthase component I  52.7 
 
 
521 aa  512  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.924364  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1913  anthranilate synthase component I  53.22 
 
 
520 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000288836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1850  anthranilate synthase component I  53.02 
 
 
520 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.174926  hitchhiker  0.00154375 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2172  anthranilate synthase component I  52.48 
 
 
520 aa  512  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1605  anthranilate synthase component I  53.22 
 
 
520 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.443711  hitchhiker  0.000400444 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1896  anthranilate synthase component I  53.22 
 
 
520 aa  515  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481284 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1423  anthranilate synthase component I  53.22 
 
 
520 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1855  anthranilate synthase component I  53.22 
 
 
520 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.945253  normal  0.19487 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01238  anthranilate synthase component I  53.61 
 
 
520 aa  510  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2384  anthranilate synthase component I  53.61 
 
 
520 aa  510  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00032032  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1868  anthranilate synthase component I  53.41 
 
 
520 aa  509  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000112472 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01248  hypothetical protein  53.61 
 
 
520 aa  510  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2312  anthranilate synthase component I  52.51 
 
 
521 aa  511  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2007  anthranilate synthase component I  53.02 
 
 
520 aa  509  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.599068  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2042  anthranilate synthase component I  52.51 
 
 
521 aa  511  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.568507  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2204  anthranilate synthase component I  52.13 
 
 
520 aa  503  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00459304 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2667  anthranilate synthase component I  51.51 
 
 
520 aa  504  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4397  anthranilate synthase component I  48.15 
 
 
491 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51360  anthranilate synthase component I  48.56 
 
 
530 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.667979  hitchhiker  0.000188045 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28130  anthranilate synthase component I  36.9 
 
 
517 aa  286  5.999999999999999e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4120  anthranilate synthase, component I  43.24 
 
 
489 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1042  anthranilate synthase component I  42.71 
 
 
496 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0071  anthranilate synthase  38.69 
 
 
417 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0747  anthranilate synthase, component I  35.15 
 
 
493 aa  283  4.0000000000000003e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2156  anthranilate synthase component I  40.54 
 
 
517 aa  283  7.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.849379  hitchhiker  0.00323016 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1251  anthranilate/para-aminobenzoate synthass component I  40.77 
 
 
485 aa  282  9e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1455  anthranilate synthase component I  41.09 
 
 
514 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.686129 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2950  anthranilate synthase component I  36.55 
 
 
525 aa  281  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427522  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0983  anthranilate synthase component I  43.07 
 
 
474 aa  280  4e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.371518  normal  0.264118 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0761  anthranilate synthase component I  39.23 
 
 
539 aa  275  1.0000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.061947  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2383  anthranilate synthase component I  41.33 
 
 
491 aa  272  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2497  anthranilate synthase, component I  40.55 
 
 
491 aa  272  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0875  anthranilate synthase, component I  40.21 
 
 
494 aa  272  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000225677  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1582  anthranilate synthase component I  41.04 
 
 
491 aa  271  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000405168  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1731  anthranilate synthase component I  41.18 
 
 
491 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2940  anthranilate synthase component I  40.39 
 
 
471 aa  271  2.9999999999999997e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.256099 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1255  anthranilate synthase component I  40.05 
 
 
500 aa  270  4e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2846  anthranilate synthase component I  37.58 
 
 
505 aa  270  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0361965  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3245  anthranilate synthase component I  37.58 
 
 
505 aa  270  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.459901  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1481  anthranilate synthase component I  39.52 
 
 
485 aa  270  5e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1271  anthranilate synthase, component I  39.52 
 
 
485 aa  268  1e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0730  anthranilate synthase, component I  42.46 
 
 
494 aa  268  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2323  anthranilate synthase, component I  35.85 
 
 
518 aa  269  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.933209  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3368  anthranilate synthase component I  40.24 
 
 
493 aa  268  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.082923  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2494  anthranilate synthase component I  38.51 
 
 
492 aa  268  2.9999999999999995e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.184686  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1804  anthranilate synthase component I  39.67 
 
 
491 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0147265 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2584  anthranilate synthase component I  37.28 
 
 
495 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0476  anthranilate synthase component I  40.67 
 
 
508 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0248  anthranilate synthase component I  40.48 
 
 
507 aa  266  7e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2250  anthranilate synthase component I  38.53 
 
 
502 aa  266  8e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.327103  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2120  anthranilate synthase component I  40.15 
 
 
503 aa  265  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.016796 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1869  anthranilate synthase component I  39.68 
 
 
475 aa  265  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2547  anthranilate synthase component I  39.71 
 
 
491 aa  265  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000521944  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1783  anthranilate synthase component I  38.52 
 
 
498 aa  265  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.589436  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1143  anthranilate synthase component I  40.16 
 
 
503 aa  264  4e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0793229 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1122  anthranilate synthase, component I  41.91 
 
 
496 aa  263  4e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00596141  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2082  anthranilate synthase component I  40.15 
 
 
491 aa  263  4.999999999999999e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3400  anthranilate synthase component I  36.63 
 
 
517 aa  263  6e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.387775  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46640  anthranilate synthase component I  36.24 
 
 
492 aa  263  6e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0342  anthranilate synthase component I  40.52 
 
 
469 aa  263  8e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0367738  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0926  anthranilate synthase component I  40.84 
 
 
490 aa  262  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0148  anthranilate synthase component I  34.95 
 
 
501 aa  262  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0417  anthranilate synthase component I  35.16 
 
 
493 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446736  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0266  anthranilate synthase component I  41.49 
 
 
501 aa  261  2e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1246  anthranilate synthase component I  36 
 
 
492 aa  261  2e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2413  anthranilate synthase component I  38.95 
 
 
491 aa  261  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1856  anthranilate synthase, component I  38.7 
 
 
512 aa  261  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.415025  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0448  anthranilate synthase component I  34.47 
 
 
493 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.422801  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1191  anthranilate synthase component I  41.3 
 
 
487 aa  261  3e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00517718  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2877  anthranilate synthase component I  40.8 
 
 
489 aa  260  4e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>