More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0315 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0315  conserved hypothetical protein, putative glutamine amidotransferase  100 
 
 		 199 aa  412  1e-114  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1416  class I glutamine amidotransferase, putative  54.55 
 
 		 200 aa  223  2e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0610081  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1750  hypothetical protein  54.49 
 
 		 179 aa  201  6e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1631  glutamine amidotransferase class-I  41.62 
 
 		 194 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5513  glutamine amidotransferase class-I  32.61 
 
 		 198 aa  115  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1405  peptidase C26  33.84 
 
 		 209 aa  110  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7109  hypothetical protein  33.15 
 
 		 204 aa  101  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0661  peptidase C26  36.89 
 
 		 212 aa  101  9e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.576889 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29431  hypothetical protein  31.16 
 
 		 207 aa  98.6  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0015  peptidase C26  31.05 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0676667 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0772  peptidase C26  31.12 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3393  peptidase C26  31.5 
 
 		 213 aa  85.9  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0727  hypothetical protein  30.46 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  30.51 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  30.18 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  28.09 
 
 		 238 aa  72  0.000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1775  glutamine amidotransferase  28.64 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113696 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  24.63 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2671  peptidase C26  30.32 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0625878 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2941  glutamine amidotransferase related enzyme  29.87 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12660  predicted glutamine amidotransferase  28.4 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0954  putative amidotransferase  29.24 
 
 		 251 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.716357 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3033  peptidase C26  28.65 
 
 		 493 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.998523  decreased coverage  0.0021965 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  26.71 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  22.84 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  28.57 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1617  glutamine amidotransferase, class I  25.44 
 
 		 444 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1964  peptidase C26  24.57 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  27.85 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0983  peptidase C26  24.85 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290196  normal  0.093467 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  26.95 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0545  peptidase C26  24.85 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  23.57 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1024  peptidase C26  24.85 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  24.76 
 
 		 602 aa  62.4  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0455  glutamine amidotransferase, class I  24.85 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5047  peptidase C26  26 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1742  peptidase C26  27.81 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0446895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0973  glutamine amidotransferase, class I  24.85 
 
 		 444 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2910  peptidase C26  24.85 
 
 		 442 aa  62  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.486072  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4137  peptidase C26  24.85 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2602  peptidase C26  24.85 
 
 		 444 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0349  peptidase C26  28.02 
 
 		 273 aa  62  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232683  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0173  peptidase C26  24.85 
 
 		 444 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2112  glutamine amidotransferase class-I:peptidase C26  28.99 
 
 		 260 aa  62  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0486861  normal  0.283308 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3017  glutamine amidotransferase, class I  24.85 
 
 		 442 aa  62  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2970  peptidase C26  24.85 
 
 		 442 aa  62  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0717  peptidase C26  26.04 
 
 		 479 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.777258  normal  0.355316 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  27.47 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0606  GMP synthase, small subunit  34.48 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  23.04 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  25 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1740  peptidase C26  26.51 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.227165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1141  putative transferase  28.07 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0928367 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  26.25 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  24.22 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2371  peptidase C26  24.26 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2009  peptidase C26  25 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  23.83 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1160  peptidase C26  25.32 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4064  peptidase C26  23.32 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  29.45 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3195  peptidase C26  24.69 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2816  peptidase C26  26.53 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3925  peptidase C26  25.81 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.792522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3226  peptidase C26  24.87 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0900  peptidase C26  24.26 
 
 		 399 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.332784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0888  peptidase C26  24.26 
 
 		 427 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  26.19 
 
 		 312 aa  58.5  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  25.71 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1613  anthranilate synthase component II  33.67 
 
 		 533 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  25.53 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  27.54 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  25.71 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0056  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  28.23 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.454168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  22.8 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  28 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  23.46 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1297  peptidase C26  29.32 
 
 		 259 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.266099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0616  peptidase C26  22 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0498  peptidase C26  27.85 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27000  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or aminodeoxychorismate synthase  26.32 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0509  peptidase C26  27.85 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0520  peptidase C26  27.85 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2010  peptidase C26  22.64 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0370  anthranilate synthase component II  35.71 
 
 		 533 aa  55.8  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0395  anthranilate synthase component II  35.71 
 
 		 533 aa  55.8  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.861809  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1549  peptidase C26  27.65 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3960  peptidase C26  25.26 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0591478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2279  peptidase C26  23.32 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  27.94 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  27.94 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0985  para-aminobenzoate synthase component II, glutamine amidotransferase  32.11 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.7799  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0608  peptidase C26  22.81 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.982002  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0121  peptidase C26  25.3 
 
 		 407 aa  54.7  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3617  aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase subunit  30.85 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.372082  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4437  para-aminobenzoate synthase component II  27.78 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0638297  normal  0.334939 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  25.44 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  27.22 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  25 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>