266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1237 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1237  peptidase C26  100 
 
 
238 aa  493  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  35.9 
 
 
273 aa  117  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  37.44 
 
 
233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  35.79 
 
 
259 aa  107  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  40.93 
 
 
231 aa  105  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  35.87 
 
 
238 aa  104  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  35.8 
 
 
240 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  40.57 
 
 
250 aa  102  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  36.42 
 
 
233 aa  102  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  37.57 
 
 
236 aa  99.4  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0888  peptidase C26  33.91 
 
 
427 aa  98.6  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0900  peptidase C26  33.91 
 
 
399 aa  98.2  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.332784  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  36.93 
 
 
312 aa  97.8  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4227  peptidase C26  31.71 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  32.37 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2671  peptidase C26  35.67 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0625878 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  38.51 
 
 
264 aa  96.3  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0608  peptidase C26  37.14 
 
 
237 aa  96.7  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.982002  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0076  peptidase C26  34.54 
 
 
236 aa  96.3  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1141  putative transferase  32.45 
 
 
266 aa  95.5  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0928367 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  32.24 
 
 
230 aa  94.7  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  29.95 
 
 
241 aa  94  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3017  glutamine amidotransferase, class I  33.71 
 
 
442 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2910  peptidase C26  33.71 
 
 
442 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.486072  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0173  peptidase C26  33.71 
 
 
444 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2970  peptidase C26  33.71 
 
 
442 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0973  glutamine amidotransferase, class I  33.71 
 
 
444 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0094  peptidase C26  34.02 
 
 
236 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000432288  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2602  peptidase C26  33.71 
 
 
444 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0455  glutamine amidotransferase, class I  33.33 
 
 
356 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0983  peptidase C26  34.29 
 
 
396 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290196  normal  0.093467 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2371  peptidase C26  33.71 
 
 
405 aa  93.2  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167921  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0545  peptidase C26  34.29 
 
 
396 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1024  peptidase C26  34.29 
 
 
396 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3991  hypothetical protein  32.35 
 
 
229 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0400316  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  31.54 
 
 
278 aa  92.4  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  31.54 
 
 
278 aa  92.4  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1617  glutamine amidotransferase, class I  33.71 
 
 
444 aa  92.4  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  33.73 
 
 
247 aa  92.4  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  32.2 
 
 
244 aa  92.4  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4137  peptidase C26  33.91 
 
 
251 aa  92  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  34.08 
 
 
238 aa  92  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0082  peptidase C26  33.51 
 
 
236 aa  92  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.831872  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  35.16 
 
 
238 aa  91.7  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1848  peptidase C26  41.52 
 
 
251 aa  91.3  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0813  peptidase C26  31.67 
 
 
264 aa  91.3  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.540694  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  31.47 
 
 
250 aa  90.5  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  38.73 
 
 
254 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  30.96 
 
 
237 aa  90.9  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  32.67 
 
 
279 aa  90.9  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  31.47 
 
 
250 aa  90.5  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  31.48 
 
 
256 aa  90.1  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  31.96 
 
 
298 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1775  glutamine amidotransferase  31.94 
 
 
227 aa  90.1  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113696 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1160  peptidase C26  31.6 
 
 
222 aa  89.7  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1297  peptidase C26  34.43 
 
 
259 aa  89.4  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.266099  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  33.33 
 
 
242 aa  89  7e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  31.53 
 
 
255 aa  88.6  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1549  peptidase C26  32.16 
 
 
258 aa  87.8  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  31.46 
 
 
262 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  28.76 
 
 
252 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  31.22 
 
 
238 aa  87  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12430  predicted glutamine amidotransferase  37.06 
 
 
247 aa  87  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124059  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  35.09 
 
 
245 aa  87.8  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2816  peptidase C26  31.75 
 
 
255 aa  86.7  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  31.14 
 
 
237 aa  86.3  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  31.12 
 
 
238 aa  86.3  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3195  peptidase C26  31.2 
 
 
241 aa  85.5  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0717  peptidase C26  33.71 
 
 
479 aa  85.5  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.777258  normal  0.355316 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0570  peptidase C26  31.94 
 
 
240 aa  85.5  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0083889  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  31.65 
 
 
235 aa  84.3  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4415  peptidase C26  34.12 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  34.73 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3226  peptidase C26  36.63 
 
 
285 aa  84.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  30.35 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3925  peptidase C26  34.71 
 
 
240 aa  82  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.792522  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1429  glutamine amidotransferase (class I), putative  31.94 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  34.44 
 
 
238 aa  82  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  31.82 
 
 
241 aa  82  0.000000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4701  peptidase C26  30 
 
 
272 aa  81.6  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2182  peptidase C26  32.84 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  32.82 
 
 
245 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1964  peptidase C26  31.82 
 
 
239 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  34.48 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0651  glutamine amidotransferase class-I  34.52 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.64648  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  32.21 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  31.43 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3033  peptidase C26  32.2 
 
 
493 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.998523  decreased coverage  0.0021965 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  29.44 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4064  peptidase C26  33.15 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2887  peptidase C26  29.03 
 
 
268 aa  79.7  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  31.52 
 
 
253 aa  79.7  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2112  glutamine amidotransferase class-I:peptidase C26  35.43 
 
 
260 aa  79.3  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0486861  normal  0.283308 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2202  peptidase C26  32.34 
 
 
268 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  28.35 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2080  peptidase C26  30.43 
 
 
268 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.285654  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3033  peptidase C26  31.19 
 
 
254 aa  79  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.008786  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2279  peptidase C26  32.4 
 
 
280 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2941  glutamine amidotransferase related enzyme  32.16 
 
 
237 aa  79  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0954  putative amidotransferase  32.04 
 
 
251 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.716357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>