211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2997 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2997  acetyltransferase-like protein  100 
 
 		 218 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3568  acetyltransferase-like protein  51.79 
 
 		 195 aa  203  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0544  hypothetical protein  41.46 
 
 		 201 aa  127  9.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0548  acetyltransferase  38.32 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0805  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 		 171 aa  87.8  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3402  GCN5-related N-acetyltransferase  25.97 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.774509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2709  GCN5-related N-acetyltransferase  25.66 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000725277 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06848  acetyltransferase  25.62 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2854  GCN5-related N-acetyltransferase  27.7 
 
 		 169 aa  67  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.931965  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1634  GCN5-related N-acetyltransferase  25.66 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0999  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303176  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  33.56 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1671  GCN5-related N-acetyltransferase  25.68 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135635  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3916  GCN5-related N-acetyltransferase  27.45 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.229048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  26 
 
 		 175 aa  64.7  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000873  putative acetyltransferase  26.03 
 
 		 171 aa  64.3  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  30.26 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107453  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1649  GCN5-related N-acetyltransferase  25.68 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0963  GCN5-related N-acetyltransferase  28.07 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00275714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3439  GCN5-related N-acetyltransferase  28.14 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0850928  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  26.35 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.121319  unclonable  0.0000303298 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0553  GCN5-related N-acetyltransferase  27.16 
 
 		 195 aa  62  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2617  GCN5-related N-acetyltransferase  27.03 
 
 		 178 aa  62  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000214426 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 		 178 aa  62  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2752  acetyltransferase  24.5 
 
 		 175 aa  61.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5249  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  30.46 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.78893 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2455  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000222061 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1769  GCN5-related N-acetyltransferase  27.45 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171854  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1834  acetyltransferase  25 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0961  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0164195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0786  acetyltransferase  31.54 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4065  acetyltransferase, GNAT family protein  28.57 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811342  normal  0.114074 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  29.8 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  23.18 
 
 		 171 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0920408  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0351  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 		 171 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.988966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2642  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.958257  normal  0.277801 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3405  GCN5-related N-acetyltransferase  28.31 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000780456  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2020  GCN5-related N-acetyltransferase  26.74 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00124051  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2273  GCN5-related N-acetyltransferase  22.22 
 
 		 171 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0202  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3530  GCN5-related N-acetyltransferase  27.71 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  27.71 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.083248  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3804  hypothetical protein  27.15 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0689439  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1047  GCN5-related N-acetyltransferase  27.71 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000813755  hitchhiker  0.000000247911 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2798  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1580  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0125256  normal  0.248889 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23000  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  25.97 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.713177  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1501  GCN5-related N-acetyltransferase  25.17 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28760  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  29.05 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0757  GCN5-related N-acetyltransferase  28.83 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583099  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1306  GCN5-related N-acetyltransferase  30.87 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3070  GCN5-related N-acetyltransferase  26.52 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000252712  hitchhiker  0.000932566 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2974  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20860  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  26.49 
 
 		 170 aa  54.3  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3943  GCN5-related N-acetyltransferase  27.63 
 
 		 181 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000968058  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1445  GCN5-related N-acetyltransferase  29.05 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0179041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2469  GCN5-related N-acetyltransferase  24.34 
 
 		 182 aa  53.9  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2313  GCN5-related N-acetyltransferase  26.35 
 
 		 183 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3046  acetyltransferase  27.03 
 
 		 180 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0847366  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0113  GCN5-related N-acetyltransferase  25.17 
 
 		 189 aa  52.8  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2643  GCN5-related N-acetyltransferase  22.82 
 
 		 177 aa  52.8  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0293381  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7134  GCN5-related N-acetyltransferase  26.19 
 
 		 174 aa  52.4  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3988  GCN5-related N-acetyltransferase  40.68 
 
 		 197 aa  52.8  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0509  GCN5-related N-acetyltransferase  28.29 
 
 		 176 aa  52  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5564  GCN5-related N-acetyltransferase  26.8 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295471  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2197  GCN5-related N-acetyltransferase  26.45 
 
 		 184 aa  52  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1747  GCN5-related N-acetyltransferase  26.32 
 
 		 176 aa  52  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00283378  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1803  GCN5-related N-acetyltransferase  28.75 
 
 		 166 aa  51.6  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1341  acetyltransferase  29.27 
 
 		 186 aa  51.6  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3517  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  27.52 
 
 		 186 aa  51.6  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4212  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 		 175 aa  51.6  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 		 168 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1848  GCN5-related N-acetyltransferase  27.92 
 
 		 167 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.905398  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2625  GCN5-related N-acetyltransferase  27.88 
 
 		 179 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3550  GCN5-related N-acetyltransferase  25.79 
 
 		 167 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  28.38 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1789  GCN5-related protein N-acetyltransferase  27.81 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.305727  normal  0.254544 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2394  GCN5-related N-acetyltransferase  26.85 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1733  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 		 174 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  27.92 
 
 		 165 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5000  GCN5-related N-acetyltransferase  27.1 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.696627  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2477  GCN5-related N-acetyltransferase  27.92 
 
 		 167 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.362276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3008  GCN5-related N-acetyltransferase  21.74 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1801  GCN5-related N-acetyltransferase  27.92 
 
 		 167 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.427986  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.35 
 
 		 180 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.776721  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2232  acetyltransferase, GNAT family  27.03 
 
 		 180 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000183087 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0475  GCN5-related N-acetyltransferase  24.32 
 
 		 179 aa  49.7  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3621  GCN5-related N-acetyltransferase  24.68 
 
 		 371 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5603  GCN5-related N-acetyltransferase  26.8 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.40665  normal  0.677013 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0077  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 		 317 aa  50.1  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1799  GCN5-related N-acetyltransferase  26.25 
 
 		 180 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.873106  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1680  GCN5-related N-acetyltransferase  28.21 
 
 		 173 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.292432 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1823  GCN5-related N-acetyltransferase  25.49 
 
 		 185 aa  49.7  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1868  acetyltransferase, GNAT family  27.52 
 
 		 176 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3670  GCN5-related N-acetyltransferase  26.8 
 
 		 183 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265816  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2618  GCN5-related N-acetyltransferase  21.02 
 
 		 178 aa  49.3  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.397987  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1276  GCN5-related N-acetyltransferase  30.57 
 
 		 171 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153843  normal  0.249566 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4697  GCN5-related N-acetyltransferase  26.8 
 
 		 183 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.478188  normal  0.278503 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4484  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.22 
 
 		 168 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>