156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3568 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3568  acetyltransferase-like protein  100 
 
 		 195 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2997  acetyltransferase-like protein  51.79 
 
 		 218 aa  203  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0544  hypothetical protein  41.11 
 
 		 201 aa  142  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0548  acetyltransferase  36.08 
 
 		 186 aa  109  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0805  GCN5-related N-acetyltransferase  35.17 
 
 		 171 aa  93.2  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2854  GCN5-related N-acetyltransferase  32.87 
 
 		 169 aa  83.6  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.931965  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  28.81 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107453  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3402  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.774509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3439  GCN5-related N-acetyltransferase  29.68 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0850928  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3916  GCN5-related N-acetyltransferase  27.81 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.229048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0786  acetyltransferase  31.76 
 
 		 169 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000873  putative acetyltransferase  28.67 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  29.09 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06848  acetyltransferase  26.9 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1834  acetyltransferase  26.9 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4461  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0216912  normal  0.010687 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2798  GCN5-related N-acetyltransferase  30.59 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2709  GCN5-related N-acetyltransferase  26.35 
 
 		 178 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000725277 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1634  GCN5-related N-acetyltransferase  26.35 
 
 		 178 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2273  GCN5-related N-acetyltransferase  27.89 
 
 		 171 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2617  GCN5-related N-acetyltransferase  25.52 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000214426 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2469  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  25.52 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.121319  unclonable  0.0000303298 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1117  GCN5-related N-acetyltransferase  29.11 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123993  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1671  GCN5-related N-acetyltransferase  25.68 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135635  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2752  acetyltransferase  27.27 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  28.83 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1649  GCN5-related N-acetyltransferase  25.68 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5564  GCN5-related N-acetyltransferase  29.19 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295471  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2455  GCN5-related N-acetyltransferase  24.83 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000222061 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2974  GCN5-related N-acetyltransferase  29.24 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0351  GCN5-related N-acetyltransferase  26.39 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.988966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0471  GCN5-related N-acetyltransferase  29.53 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000161349  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1306  GCN5-related N-acetyltransferase  28.65 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1580  GCN5-related N-acetyltransferase  26.35 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0125256  normal  0.248889 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  24.83 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0920408  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.78893 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5169  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  25.66 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003301  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4634  GCN5-related N-acetyltransferase  25.14 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.490299  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0144  acetyltransferase  30.2 
 
 		 184 aa  53.1  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.660916  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  27.54 
 
 		 168 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000080  putative acetyltransferase  28.57 
 
 		 169 aa  53.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.241329  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1173  GCN5-related N-acetyltransferase  31.08 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1823  GCN5-related N-acetyltransferase  26.11 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4749  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  25.83 
 
 		 179 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  26.58 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.684  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3740  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  23.3 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 		 178 aa  52.4  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4734  acetytransferase  25 
 
 		 173 aa  52  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4367  GCN5-related N-acetyltransferase  23.98 
 
 		 187 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5164  acetyltransferase, putative  25 
 
 		 181 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0077  GCN5-related N-acetyltransferase  28.97 
 
 		 317 aa  51.6  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1643  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 		 176 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163456  normal  0.836234 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28760  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  25.47 
 
 		 179 aa  51.2  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0820  acetyltransferase  22.09 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17840  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  25.5 
 
 		 359 aa  50.1  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1263  acetyltransferase  25.81 
 
 		 180 aa  50.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173592 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0843  GCN5-related N-acetyltransferase  22.09 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2032  GCN5-related N-acetyltransferase  25.69 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0857  GCN5-related N-acetyltransferase  22.09 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5179  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  24.34 
 
 		 173 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  28.19 
 
 		 179 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430017  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6345  GCN5-related N-acetyltransferase  24.14 
 
 		 174 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.881821  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2749  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.39 
 
 		 180 aa  49.3  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000127055  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3361  GCN5-related N-acetyltransferase  24.48 
 
 		 185 aa  49.3  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0664869  normal  0.190912 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3550  GCN5-related N-acetyltransferase  26.39 
 
 		 167 aa  49.3  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0079  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  24.5 
 
 		 173 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1291  GCN5-related N-acetyltransferase  28.87 
 
 		 177 aa  49.3  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000284437  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1680  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 		 173 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.292432 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3943  GCN5-related N-acetyltransferase  25.68 
 
 		 181 aa  48.5  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000968058  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5000  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.696627  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3046  acetyltransferase  26.39 
 
 		 180 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0847366  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0766  GCN5-related N-acetyltransferase  27.15 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2859  acetyltransferase, GNAT family  27.49 
 
 		 168 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464219 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3009  acetyltransferase, GNAT family  26.39 
 
 		 180 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1747  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 		 176 aa  48.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00283378  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7134  GCN5-related N-acetyltransferase  25.23 
 
 		 174 aa  48.1  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4212  GCN5-related N-acetyltransferase  29.03 
 
 		 175 aa  48.1  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3045  acetyltransferase, GNAT family  26.39 
 
 		 180 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.300974  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0999  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303176  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2474  acetyltransferase, GNAT family  27.65 
 
 		 168 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1444  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 141 aa  47.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2496  GCN5-related N-acetyltransferase  25.64 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20860  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  25 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  25.68 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2232  acetyltransferase, GNAT family  25.69 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000183087 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3008  GCN5-related N-acetyltransferase  24.03 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2798  acetyltransferase  25.69 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.036966  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1047  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000813755  hitchhiker  0.000000247911 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1239  GCN5-related N-acetyltransferase  25.27 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.686907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3008  acetyltransferase, GNAT family  25.69 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400809 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3010  acetyltransferase  25.69 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3179  GCN5-related N-acetyltransferase  24.32 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0961  GCN5-related N-acetyltransferase  24.36 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0164195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0757  GCN5-related N-acetyltransferase  24.5 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583099  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1005  GCN5-related N-acetyltransferase  26.11 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1445  GCN5-related N-acetyltransferase  23.94 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0179041  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>