237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0544 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0544  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  422  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0548  acetyltransferase  47.85 
 
 
186 aa  177  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3568  acetyltransferase-like protein  41.11 
 
 
195 aa  142  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2997  acetyltransferase-like protein  41.46 
 
 
218 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0805  GCN5-related N-acetyltransferase  28.21 
 
 
171 aa  77  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3402  GCN5-related N-acetyltransferase  24.07 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.774509  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3439  GCN5-related N-acetyltransferase  27.04 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0850928  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1173  GCN5-related N-acetyltransferase  28.66 
 
 
195 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5169  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  25.65 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5164  acetyltransferase, putative  25.65 
 
 
181 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
189 aa  63.2  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.684  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4749  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  25.51 
 
 
179 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  28.66 
 
 
205 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107453  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4734  acetytransferase  26.56 
 
 
173 aa  62  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5179  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  26.56 
 
 
173 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2643  GCN5-related N-acetyltransferase  23.43 
 
 
177 aa  60.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0293381  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
187 aa  60.5  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2232  acetyltransferase, GNAT family  28.74 
 
 
180 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000183087 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2752  acetyltransferase  23.26 
 
 
175 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5249  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  28.75 
 
 
193 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3009  acetyltransferase, GNAT family  28.74 
 
 
180 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2469  GCN5-related N-acetyltransferase  26.25 
 
 
182 aa  60.5  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2798  acetyltransferase  28.14 
 
 
180 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.036966  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2749  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.14 
 
 
180 aa  59.3  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000127055  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3008  acetyltransferase, GNAT family  28.14 
 
 
180 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400809 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3010  acetyltransferase  28.14 
 
 
180 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3046  acetyltransferase  28.14 
 
 
180 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0847366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0079  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  23.68 
 
 
173 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.14 
 
 
180 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.776721  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  27.98 
 
 
186 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.78893 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4634  GCN5-related N-acetyltransferase  25.91 
 
 
206 aa  57.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.490299  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0471  GCN5-related N-acetyltransferase  27.49 
 
 
196 aa  56.6  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000161349  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3045  acetyltransferase, GNAT family  28.14 
 
 
180 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.300974  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21710  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  27.92 
 
 
185 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.649805 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2798  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
176 aa  56.6  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4065  acetyltransferase, GNAT family protein  26.92 
 
 
178 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811342  normal  0.114074 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2854  GCN5-related N-acetyltransferase  23.7 
 
 
169 aa  55.5  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.931965  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0757  GCN5-related N-acetyltransferase  25.16 
 
 
181 aa  55.1  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583099  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0077  GCN5-related N-acetyltransferase  27.75 
 
 
317 aa  55.1  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0475  GCN5-related N-acetyltransferase  25.57 
 
 
179 aa  55.1  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2032  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
188 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  26.01 
 
 
168 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0927  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.84 
 
 
191 aa  53.9  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2313  GCN5-related N-acetyltransferase  25.64 
 
 
183 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4661  acetyltransferase, GNAT family  25.32 
 
 
189 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4294  histone deacetylase family protein  25.33 
 
 
189 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1981  protein of unknown function DUF523  24.47 
 
 
354 aa  53.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3550  GCN5-related N-acetyltransferase  25.37 
 
 
167 aa  53.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1680  GCN5-related N-acetyltransferase  26.26 
 
 
173 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292432 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0373  GCN5-related N-acetyltransferase  23.33 
 
 
187 aa  53.1  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.970254  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2013  GCN5-related N-acetyltransferase  28.39 
 
 
191 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1005  GCN5-related N-acetyltransferase  27.65 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003301  GCN5-related N-acetyltransferase  27.54 
 
 
181 aa  53.1  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5257  acetyltransferase, putative  24.05 
 
 
200 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.727946 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1823  GCN5-related N-acetyltransferase  23.33 
 
 
185 aa  53.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0961  GCN5-related N-acetyltransferase  29.31 
 
 
197 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0164195  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0263  spermidine N1-acetyltransferase, putative  24.87 
 
 
180 aa  52.4  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4991  GCN5-related N-acetyltransferase  26.85 
 
 
192 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0659078  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3916  GCN5-related N-acetyltransferase  24.12 
 
 
179 aa  52.4  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.229048  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2273  GCN5-related N-acetyltransferase  22.64 
 
 
171 aa  52  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2496  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
193 aa  52.4  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  25.4 
 
 
204 aa  52  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329985  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2974  GCN5-related N-acetyltransferase  28.24 
 
 
183 aa  51.6  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1306  GCN5-related N-acetyltransferase  28.82 
 
 
183 aa  51.6  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  25.16 
 
 
175 aa  51.6  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0113  GCN5-related N-acetyltransferase  28.29 
 
 
189 aa  51.6  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0849  acetyltransferase  24.47 
 
 
188 aa  51.6  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5564  GCN5-related N-acetyltransferase  27.22 
 
 
191 aa  51.2  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2946  acetyltransferase, GNAT family  33.63 
 
 
183 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000111419  decreased coverage  0.00000000013504 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4775  GCN5-related N-acetyltransferase  25.33 
 
 
189 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110817  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1783  GCN5-related N-acetyltransferase  27.1 
 
 
190 aa  50.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28760  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  26.97 
 
 
179 aa  51.2  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_152  acetyltransferase, GNAT family  25.38 
 
 
183 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1671  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
178 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135635  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3179  GCN5-related N-acetyltransferase  26.32 
 
 
208 aa  51.2  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  26.62 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2385  acetyltransferase, GNAT family  33.63 
 
 
183 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000643226  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3804  hypothetical protein  23.98 
 
 
188 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0689439  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4461  GCN5-related N-acetyltransferase  25.71 
 
 
186 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0216912  normal  0.010687 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1955  acetyltransferase  28.05 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.557592  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1637  acetyltransferase  25.81 
 
 
186 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2709  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
178 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000725277 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17840  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  25.68 
 
 
359 aa  50.1  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4917  GCN5-related N-acetyltransferase  24.36 
 
 
189 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1984  acetyltransferase, GNAT family  27.44 
 
 
176 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.819298  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1634  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
178 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1868  acetyltransferase, GNAT family  26.54 
 
 
176 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3988  GCN5-related N-acetyltransferase  27.45 
 
 
197 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3943  GCN5-related N-acetyltransferase  25.66 
 
 
181 aa  49.3  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000968058  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  24.1 
 
 
189 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20860  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  24 
 
 
170 aa  49.7  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1163  hypothetical protein  23.72 
 
 
196 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3474  acetyltransferase, GNAT family  25.93 
 
 
176 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000305522 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000080  putative acetyltransferase  25.29 
 
 
169 aa  49.3  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.241329  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2264  GCN5-related N-acetyltransferase  27.45 
 
 
165 aa  48.9  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0963  GCN5-related N-acetyltransferase  28.12 
 
 
197 aa  48.9  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00275714  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1738  acetyltransferase  27.44 
 
 
176 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1714  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.44 
 
 
176 aa  48.5  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000230477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1876  acetyltransferase  27.44 
 
 
176 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3234  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 
185 aa  48.5  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.812854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>